RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444685.1

CBX1-204, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 5

Gene CBX1, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-204ENST00000444685 ZNF114Q8NC26 417 aa3.58□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 BEST4Q8NFU0 473 aa3.58□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 OR4C16Q8NGL9 310 aa3.58□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 COQ8AQ8NI60 647 aa3.58□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 LGALS14Q8TCE9 139 aa3.58□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa3.58□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 FCAMRQ8WWV6 532 aa3.58□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 GFI1Q99684 422 aa3.58□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 PDCD10Q9BUL8 212 aa3.58□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 Q9H3A6 140 aa3.58□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 C8orf4Q9NR00 106 aa3.58□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 DIABLOQ9NR28 239 aa3.58□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa3.58□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa3.57□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa3.57□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 TMEM235A6NFC5 223 aa3.57□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 CLN5O75503 358 aa3.57□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 ADAP1O75689 374 aa3.57□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 RLN1P04808 185 aa3.57□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 RAB3BP20337 219 aa3.57□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 OR10A3P58181 314 aa3.57□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 PRCDQ00LT1 54 aa3.57□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa3.57□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 IDNKQ5T6J7 187 aa3.57□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 LPCAT3Q6P1A2 487 aa3.57□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 FOXI2Q6ZQN5 318 aa3.57□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 NFE4Q86UQ8 179 aa3.57□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 SLC35G3Q8N808 338 aa3.57□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 OR4X1Q8NH49 305 aa3.57□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 S100A14Q9HCY8 104 aa3.57□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 ZNF586Q9NXT0 402 aa3.57□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 KLK11Q9UBX7 282 aa3.57□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 ATG12O94817 140 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 RD3LP0DJH9 198 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 HTN1P15515 57 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 RPL5P46777 297 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 RORCP51449 518 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 FABP5Q01469 135 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 TIGITQ495A1 244 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 FAM78BQ5VT40 261 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 SAMD13Q5VXD3 122 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 ETFRF1Q6IPR1 90 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 SFXN4Q6P4A7 337 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 DHRS11Q6UWP2 260 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 GPR141Q7Z602 305 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 SLC51BQ86UW2 128 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 HOGA1Q86XE5 327 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 OR5AP2Q8NGF4 316 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 OR1S2Q8NGQ3 325 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 OR10J6PQ8NGY7 276 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 SUN5Q8TC36 379 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 UHRF2Q96PU4 802 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 LINC01587Q99440 93 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 IFT46Q9NQC8 304 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 RPRMQ9NS64 109 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 TPRKBQ9Y3C4 175 aa3.56□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 APOBP04114 4563 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 TRAV18A0A075B6X5 111 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 A0A0B4J293 547 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 GPR31O00270 319 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 BUB3O43684 328 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 INSP01308 110 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 IL4P05112 153 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 FCER2P06734 321 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 SLC25A4P12235 298 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 PTHLHP12272 177 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 PSMB9P28065 219 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 OR10J1P30954 320 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 PSMB3P49720 205 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 TSPAN5P62079 268 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 DHODHQ02127 395 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 FCN2Q15485 313 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 C1orf158Q8N1D5 194 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 PACRGLQ8N7B6 248 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 RXFP4Q8TDU9 374 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 FCGR1BQ92637 280 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 TMEM18Q96B42 140 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 MGLLQ99685 303 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 UPK3BQ9BT76 320 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 SLC35B3Q9H1N7 401 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 RHBDL2Q9NX52 303 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 EHFQ9NZC4 300 aa3.55□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CBX1-204ENST00000444685 LRP1BQ9NZR2 4599 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms