RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625282.2

SPTAN1-210, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 2

Gene SPTAN1, Length 4,102 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-210ENST00000625282 NCR2O95944 276 aa7.4□□□□□ -1.22
SPTAN1-210ENST00000625282 PYYP10082 97 aa7.4□□□□□ -1.22
SPTAN1-210ENST00000625282 SLC25A53Q5H9E4 307 aa7.4□□□□□ -1.22
SPTAN1-210ENST00000625282 LINC00596Q86U02 117 aa7.4□□□□□ -1.22
SPTAN1-210ENST00000625282 ZNF479Q96JC4 524 aa7.4□□□□□ -1.22
SPTAN1-210ENST00000625282 PCNX1Q96RV3 2341 aa7.4□□□□□ -1.22
SPTAN1-210ENST00000625282 TRAV3A0A0B4J244 114 aa7.4□□□□□ -1.22
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SPTAN1-210ENST00000625282 IGLV2-8P01709 118 aa7.4□□□□□ -1.23
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SPTAN1-210ENST00000625282 TMEM95Q3KNT9 176 aa7.4□□□□□ -1.23
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SPTAN1-210ENST00000625282 C20orf78Q9BR46 151 aa7.4□□□□□ -1.23
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SPTAN1-210ENST00000625282 FAM214BQ7L5A3 538 aa7.39□□□□□ -1.23
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SPTAN1-210ENST00000625282 IGF2RP11717 2491 aa7.39□□□□□ -1.23
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SPTAN1-210ENST00000625282 PAXXQ9BUH6 204 aa7.39□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
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SPTAN1-210ENST00000625282 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa7.39□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 H3BTX0 84 aa7.39□□□□□ -1.23
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SPTAN1-210ENST00000625282 INSL3P51460 131 aa7.39□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 C18orf15Q96N68 181 aa7.39□□□□□ -1.23
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SPTAN1-210ENST00000625282 J3QT63 122 aa7.38□□□□□ -1.23
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SPTAN1-210ENST00000625282 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 PRSS33Q8NF86 280 aa7.38□□□□□ -1.23
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SPTAN1-210ENST00000625282 IGHV3-48P01763 117 aa7.38□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
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SPTAN1-210ENST00000625282 LCNL1Q6ZST4 164 aa7.38□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 C8orf86Q6ZUL3 223 aa7.38□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 FDCSPQ8NFU4 85 aa7.38□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 OOEPA6NGQ2 149 aa7.37□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 PRSS1P07477 247 aa7.37□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 RFPL3SP0C7P2 107 aa7.37□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa7.37□□□□□ -1.23
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SPTAN1-210ENST00000625282 A0A1W2PRD5 423 aa7.37□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 A0A1W2PRF3 423 aa7.37□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 A0A1W2PRM7 423 aa7.37□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 RAC3P60763 192 aa7.37□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 PSG8Q9UQ74 426 aa7.37□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 DOCK10Q96BY6 2186 aa7.37□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 ABCA1O95477 2261 aa7.37□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 CACNA1AO00555 2505 aa7.37□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 KMT2EQ8IZD2 1858 aa7.37□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 GAGE5Q13069 117 aa7.37□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 GAGE6Q13070 117 aa7.37□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 PDPNQ86YL7 162 aa7.37□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 OR9G1Q8NH87 305 aa7.37□□□□□ -1.23
SPTAN1-210ENST00000625282 SPATA25Q9BR10 227 aa7.37□□□□□ -1.23
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