RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548092.5

TRAFD1-204, Transcript of TRAF-type zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRAFD1, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1-204ENST00000548092 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 HES4Q9HCC6 221 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 NRN1Q9NPD7 142 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 KCNIP2Q9NS61 270 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 SLC39A9Q9NUM3 307 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 IL36BQ9NZH7 164 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 PPIAL4AQ9Y536 164 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa3.35□□□□□ -1.87
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TRAFD1-204ENST00000548092 A0A1W2PS18 150 aa3.35□□□□□ -1.87
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TRAFD1-204ENST00000548092 SLC22A20A6NK97 555 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 PMS2P5A8MQ11 134 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 C9JCJ5 164 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 F2Z2F3 143 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP3.35□□□□□ -1.87
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TRAFD1-204ENST00000548092 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
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TRAFD1-204ENST00000548092 C10orf128Q5T292 105 aa3.35□□□□□ -1.87
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TRAFD1-204ENST00000548092 TMEM147Q9BVK8 224 aa3.35□□□□□ -1.87
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TRAFD1-204ENST00000548092 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
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TRAFD1-204ENST00000548092 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa3.34□□□□□ -1.87
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TRAFD1-204ENST00000548092 IGKV1D-39P04432 117 aa3.34□□□□□ -1.87
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TRAFD1-204ENST00000548092 IGKV1-13P0DP09 117 aa3.34□□□□□ -1.87
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TRAFD1-204ENST00000548092 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 HLA-DRB5Q30154 266 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 SMIM21Q3B7S5 101 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa3.34□□□□□ -1.87
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TRAFD1-204ENST00000548092 Q6ZVH6 145 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAFD1-204ENST00000548092 BAGE3Q86Y29 109 aa3.34□□□□□ -1.87
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