RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
NISCH-213ENST00000489895 TMEM219Q86XT9 240 aa13.96□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 BPESC1Q9GZL8 116 aa13.96□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 TMEM242Q9NWH2 141 aa13.96□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 OR10J3Q5JRS4 329 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 TMEM170AQ8WVE7 144 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 TCF23Q7RTU1 214 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 CYTL1Q9NRR1 136 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 LINC00527Q9UJ94 153 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 LMO1P25800 156 aa13.95□□□□□ -0.18
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NISCH-213ENST00000489895 LYPD2Q6UXB3 125 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 LINC00473A8K010 186 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 H7C2G1 150 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 TMEM50AO95807 157 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 C1QTNF9P0C862 333 aa13.95□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 FAM223BA6NKX1 122 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 TEX38Q6PEX7 206 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 FAM223AQ8IWN6 122 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 SMIM12Q96EX1 92 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 ST20Q9HBF5 79 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 FNDC10F2Z333 226 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 MUC21A0A140T8X8 626 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 BEND2Q8NDZ0 799 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 GLMPQ8WWB7 406 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 SOD3P08294 240 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 RNF144BQ7Z419 303 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 OCC1Q8TAD7 63 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 NEUROG1Q92886 237 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 C18orf15Q96N68 181 aa13.94□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 TNFSF13O75888 250 aa13.93□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 GCSAMLQ5JQS6 135 aa13.93□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 BRD3OSQ6XYD6 125 aa13.93□□□□□ -0.18
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NISCH-213ENST00000489895 HOXA5P20719 270 aa13.93□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 C9orf139Q6ZV77 190 aa13.93□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 OR5AN1Q8NGI8 311 aa13.93□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 TSKUQ8WUA8 353 aa13.93□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 GNB1LQ9BYB4 327 aa13.92□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 VSIRQ9H7M9 311 aa13.92□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 TRAV3A0A0B4J244 114 aa13.92□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 LINC01549A6NIU2 74 aa13.92□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa13.92□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 A6NNC1 897 aa13.92□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 ATRAIDQ6UW56 229 aa13.92□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 EMP1P54849 157 aa13.91□□□□□ -0.18
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NISCH-213ENST00000489895 UBE2E1P51965 193 aa13.91□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 MRAP2Q96G30 205 aa13.91□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 FOXC2Q99958 501 aa13.91□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 TRAV5A0A0B4J249 113 aa13.91□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 LYL1P12980 280 aa13.91□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 MSMBP08118 114 aa13.91□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 LYPD1Q8N2G4 141 aa13.91□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 MYO7BQ6PIF6 2116 aa13.9□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 SAA4P35542 130 aa13.9□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP13.9□□□□□ -0.185e-7■■■■□ 23
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NISCH-213ENST00000489895 TTC9CQ8N5M4 171 aa13.9□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 PRSS33Q8NF86 280 aa13.9□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 AKAP6Q13023 2319 aa13.9□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 COL6A6A6NMZ7 2263 aa13.9□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa13.9□□□□□ -0.18
NISCH-213ENST00000489895 TCF21O43680 179 aa13.89□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 HTN3P15516 51 aa13.89□□□□□ -0.19
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NISCH-213ENST00000489895 PRDM13Q9H4Q3 707 aa13.89□□□□□ -0.19
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NISCH-213ENST00000489895 ORMDL2Q53FV1 153 aa13.89□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 C11orf44Q8N8P7 122 aa13.89□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 LY96Q9Y6Y9 160 aa13.89□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 IGLV1-44P01699 117 aa13.89□□□□□ -0.19
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NISCH-213ENST00000489895 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa13.88□□□□□ -0.19
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NISCH-213ENST00000489895 PIP4P2Q8N4L2 257 aa13.88□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 CACNA1BQ00975 2339 aa13.88□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 RPRMLQ8N4K4 120 aa13.88□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 SMIM13P0DJ93 91 aa13.88□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 LINC00477Q96M19 166 aa13.88□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 AGMATQ9BSE5 352 aa13.88□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 DOCK8Q8NF50 2099 aa13.88□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 PLXNA2O75051 1894 aa13.88□□□□□ -0.19
NISCH-213ENST00000489895 LY6HO94772 140 aa13.88□□□□□ -0.19
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