RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273179.9

CTDSPL-201, Transcript of CTD small phosphatase like, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSPL, Length 4,459 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL-201ENST00000273179 CRIPAKQ8N1N5 446 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 OR8A1Q8NGG7 326 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 CLDND2Q8NHS1 167 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 PATJQ8NI35 1801 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 ARL16Q0P5N6 197 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 FAM53BQ14153 422 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 FGF13Q92913 245 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 SLC25A38Q96DW6 304 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 FMC1Q96HJ9 113 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 MIA3Q5JRA6 1907 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 DOCK4Q8N1I0 1966 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 RRN3P1Q2M238 152 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 IGF1P05019 195 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 PI3P19957 117 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 KIAA0040Q15053 153 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 Q6ZSR3 168 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 TM2D1Q9BX74 207 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 METTL26Q96S19 204 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 PYGO2Q9BRQ0 406 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 RNF126Q9BV68 326 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 MOB4Q9Y3A3 225 aa7.29□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 VPS13AQ96RL7 3174 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 FRMPD3Q5JV73 1810 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 M0R1B8 84 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 RBP4P02753 201 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 DEFB134Q4QY38 66 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 FAM78AQ5JUQ0 283 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 CARD19Q96LW7 228 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 AAMDCQ9H7C9 122 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 STATHP02808 62 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 MPDZO75970 2070 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 SAA4P35542 130 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 CX3CL1P78423 397 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 MDFICQ9P1T7 246 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 POLEQ07864 2286 aa7.28□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 MUC3AQ02505 3323 aa7.27□□□□□ -1.24
CTDSPL-201ENST00000273179 TMEM178BH3BS89 294 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 K7ERJ3 54 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 CXCL5P42830 114 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 DPH3Q96FX2 82 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 CXXC4Q9H2H0 198 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 CACNG7P62955 275 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 PAX8Q06710 450 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 CR1LQ2VPA4 569 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 NABP2Q9BQ15 211 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 TMEM202A6NGA9 273 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 C15orf65H3BRN8 121 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 CST7O76096 145 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 COX7CP15954 63 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 MSRB3Q8IXL7 192 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 GPHA2Q96T91 129 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 TIMM17AQ99595 171 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 CMC2Q9NRP2 79 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 YPEL1O60688 119 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 LOXL3P58215 753 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 COL4A6Q14031 1691 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 PRIMA1Q86XR5 153 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 OR5C1Q8NGR4 320 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 TSKUQ8WUA8 353 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 YPEL2Q96QA6 119 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 C5orf66Q9H5L9 145 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 CFAP54Q96N23 3096 aa7.26□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 SHISA3A0PJX4 238 aa7.26□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 LCNL1Q6ZST4 164 aa7.26□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 RPS4Y2Q8TD47 263 aa7.26□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 KLK13Q9UKR3 277 aa7.26□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 SVILO95425 2214 aa7.26□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 H0YIZ8 118 aa7.26□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 ZNF134P52741 427 aa7.26□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa7.26□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 C11orf45Q8TAV5 145 aa7.26□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 LINC01553A4QN01 128 aa7.26□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 VWC2LB2RUY7 222 aa7.26□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 CRYGSP22914 178 aa7.26□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 NUP35Q8NFH5 326 aa7.26□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa7.25□□□□□ -1.25
CTDSPL-201ENST00000273179 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.5 ms