RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464495.4

SOGA3-204, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene SOGA3, Length 900 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-204ENST00000464495 FXYD7P58549 80 aa6.8□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 FXYD4P59646 89 aa6.8□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa6.8□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 OR4C16Q8NGL9 310 aa6.8□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 OR4A16Q8NH70 328 aa6.8□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa6.8□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.8□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa6.79□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 M0QYG6 137 aa6.79□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP6.79□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 DEFB130BP0DP73 79 aa6.79□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 DEFB130AP0DP74 79 aa6.79□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 G6PCP35575 357 aa6.79□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 ID1P41134 155 aa6.79□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 LPAR6P43657 344 aa6.79□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 HERV-K104P61576 105 aa6.79□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 RPS25P62851 125 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa6.79□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 TMEM17Q86X19 198 aa6.79□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 CMTM1Q8IZ96 169 aa6.79□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 BEST4Q8NFU0 473 aa6.79□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.79□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa6.79□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.79□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa6.79□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 TMEM235A6NFC5 223 aa6.78□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 IFITM5A6NNB3 132 aa6.78□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 CLN5O75503 358 aa6.78□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 RLN1P04808 185 aa6.78□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 HSMCR30P0CW71 290 aa6.78□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 S100GP29377 79 aa6.78□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 PPP5CP53041 499 aa6.78□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 PSG9Q00887 426 aa6.78□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 PRCDQ00LT1 54 aa6.78□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 EBLN2Q6P2I7 272 aa6.78□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 C16orf54Q6UWD8 224 aa6.78□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa6.78□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 TMEM91Q6ZNR0 172 aa6.78□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.78□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa6.78□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 COQ8AQ8NI60 647 aa6.78□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 LGALS14Q8TCE9 139 aa6.78□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 Q8WTZ3 238 aa6.78□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 SCPEP1Q9HB40 452 aa6.78□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 ACOT13Q9NPJ3 140 aa6.78□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.78□□□□□ -1.32
SOGA3-204ENST00000464495 CBY3A6NI87 242 aa6.77□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 MYL9P24844 172 aa6.77□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 OPRK1P41145 380 aa6.77□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 B2MP61769 119 aa6.77□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 DHRSXQ8N5I4 330 aa6.77□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 GLMPQ8WWB7 406 aa6.77□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 FCAMRQ8WWV6 532 aa6.77□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 LINC00052Q96N35 136 aa6.77□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 UPK3BQ9BT76 320 aa6.77□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.77□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.77□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 LINC00315P59091 139 aa6.76□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 PQLC1Q8N2U9 271 aa6.76□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 ZNF709Q8N972 641 aa6.76□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 OR6F1Q8NGZ6 308 aa6.76□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 OR4X1Q8NH49 305 aa6.76□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 ABHD1Q96SE0 405 aa6.76□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 PDCD10Q9BUL8 212 aa6.76□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.76□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa6.75□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 PTGES3LE9PB15 166 aa6.75□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 RAB3BP20337 219 aa6.75□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 GCSHP23434 173 aa6.75□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 PSMB3P49720 205 aa6.75□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 RORCP51449 518 aa6.75□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 OR10A3P58181 314 aa6.75□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 TMEM69Q5SWH9 247 aa6.75□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 NFE4Q86UQ8 179 aa6.75□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 C1orf158Q8N1D5 194 aa6.75□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 SLC35G3Q8N808 338 aa6.75□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.75□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 SLC35B3Q9H1N7 401 aa6.75□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 ENY2Q9NPA8 101 aa6.75□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 C8orf4Q9NR00 106 aa6.75□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 SCN3BQ9NY72 215 aa6.75□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.75□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 ADAP1O75689 374 aa6.74□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 TSPOP30536 169 aa6.74□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 CBX5P45973 191 aa6.74□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 HSPA13P48723 471 aa6.74□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 KRTAP10-1P60331 282 aa6.74□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 FABP5Q01469 135 aa6.74□□□□□ -1.33
SOGA3-204ENST00000464495 TIGITQ495A1 244 aa6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.5 ms