RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580949.1

PTPRM-213, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 3

Gene PTPRM, Length 687 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-213	ENST00000580949	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949		Q6YL49	198 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	P2RX4	Q99571	388 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	HRH4	Q9H3N8	390 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	PARP11	Q9NR21	331 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	RPRM	Q9NS64	109 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949		A0A1W2PN81	502 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	ZNF785	A8K8V0	405 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	UMAD1	C9J7I0	102 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	TRIM77	I1YAP6	450 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	PLXNB1	O43157	2135 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	YIF1A	O95070	293 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	TNFRSF6B	O95407	300 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	PRH1	P02810	166 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	TMEM11	P17152	192 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	FGF7	P21781	194 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	S100A1	P23297	94 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	CHRNA7	P36544	502 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	SNCA	P37840	140 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	CAMLG	P49069	296 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	RAB5C	P51148	216 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	RAB2A	P61019	212 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	RAB11A	P62491	216 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	CX3CL1	P78423	397 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	GAMT	Q14353	236 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	SLC25A24	Q6NUK1	477 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	ACSM6	Q6P461	480 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949		Q6ZRG5	221 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	SSX7	Q7RTT5	188 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949		Q8N9W7	124 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	MARC2	Q969Z3	335 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949		Q96MF0	132 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	MGST2	Q99735	147 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	GGACT	Q9BVM4	153 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	SMCO3	A2RU48	225 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949		C9JQL5	133 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	AGPAT2	O15120	278 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	ACTL6B	O94805	426 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	CNIH1	O95406	144 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	TGFA	P01135	160 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	IGHV3-48	P01763	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	CRYGC	P07315	174 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	LINC00869	P0C866	280 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	FAM106CP	P0CH98	169 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	BRS3	P32247	399 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	SERF2	P84101	59 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	NDP	Q00604	133 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	ZNF616	Q08AN1	781 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	FXYD3	Q14802	87 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	PLGLA	Q15195	96 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	ABCA1	O95477	2261 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	PDZD2	O15018	2839 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PTPRM-213	ENST00000580949	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms