RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578706.5

UBB-208, Transcript of ubiquitin B, human

TSL 3

Gene UBB, Length 500 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBB-208	ENST00000578706	WDR61	Q9GZS3	305 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	KIAA1456	Q9P272	454 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		4.9	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	HSPG2	P98160	4391 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	ODF3B	A8MYP8	253 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	SLC31A2	O15432	143 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	SOX15	O60248	233 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	IFNA17	P01571	189 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	MB	P02144	154 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	BRS3	P32247	399 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	FHIT	P49789	147 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	RUNX1	Q01196	453 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	ARL16	Q0P5N6	197 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	ZNF273	Q14593	569 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	GUCA2B	Q16661	112 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	RTL8B	Q17RB0	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	VWC2	Q2TAL6	325 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	ATRAID	Q6UW56	229 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	ZNF329	Q86UD4	541 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	ZNF714	Q96N38	554 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	OR4C12	Q96R67	309 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	GGACT	Q9BVM4	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		4.89	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	DNAH2	Q9P225	4427 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	C15orf61	A6NNL5	157 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706		M0QZK8	103 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	CCL24	O00175	119 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	MPDU1	O75352	247 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	APOA2	P02652	100 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	RBP4	P02753	201 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	OR9G9	P0C7N8	305 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	CTRB1	P17538	263 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	CD24	P25063	80 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	GNG10	P50151	68 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	PPT1	P50897	306 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	PMS2P11	Q13670	270 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	LINC00311	Q8N616	119 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	ZNF383	Q8NA42	475 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	ZNF596	Q8TC21	504 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	LEAP2	Q969E1	77 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	RHOV	Q96L33	236 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	DUX3	Q96PT4	197 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	TMEM14B	Q9NUH8	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	TMEM140	Q9NV12	185 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	PRND	Q9UKY0	176 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706		A0A087X0M5	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706		A0A1B0GX30	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706		A0A1W2PPE3	182 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	C15orf62	A8K5M9	175 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706		C9JQL5	133 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	TSPAN4	O14817	238 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	MMP23A	O75900	390 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	IFNA1	P01562	189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	IFNA10	P01566	189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	IGHV3-7	P01780	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	AMY1A	P04745	511 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBB-208	ENST00000578706	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63

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