RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548220.1

PTPRR-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRR, Length 1,374 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-207ENST00000548220 ZFHX3Q15911 3703 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 TRAV41A0A0B4J266 112 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 A0A0G2JLM5 398 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 CGB1A6NKQ9 187 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 FAM223BA6NKX1 122 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 CEBPZOSA8MTT3 80 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 TAAR5O14804 337 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 SOX15O60248 233 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 ELANEP08246 267 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 OR13C7P0DN81 318 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 PAX6P26367 422 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 VAMP2P63027 116 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 HBG1P69891 147 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 HBG2P69892 147 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 CFHR3Q02985 330 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 WT1-ASQ06250 92 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 FOXL1Q12952 345 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 FOXE3Q13461 319 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 RAB32Q13637 225 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 TEX38Q6PEX7 206 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 FAM223AQ8IWN6 122 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 NECAP1Q8NC96 275 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 SLC24A4Q8NFF2 622 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 VN1R17PQ8TDU5 208 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 AQP10Q96PS8 301 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 RBKSQ9H477 322 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 ZNF702PQ9H963 129 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 SERTAD4Q9NUC0 356 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 OR5AC2Q9NZP5 309 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 FBXL7Q9UJT9 491 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 A0A1B0GW64 132 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 CLPSL1A2RUU4 121 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 KRBOX1C9JBD0 128 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 ATP6V0E1O15342 81 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 MPDU1O75352 247 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 SCGB2A1O75556 95 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 TPT1P13693 172 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 ZP3P21754 424 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 NPY1RP25929 384 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 PSMB8P28062 276 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 SULT1A1P50225 295 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 PAX9P55771 341 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 Q6ZSV7 163 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 STX12Q86Y82 276 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 BAP18Q8IXM2 172 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 TMEM116Q8NCL8 245 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 LFNGQ8NES3 379 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 MYOZ3Q8TDC0 251 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 P2RX4Q99571 388 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 CYTL1Q9NRR1 136 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 PSENENQ9NZ42 101 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 STAB1Q9NY15 2570 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 E7EUB6 86 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 SSSCA1O60232 199 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 DFFBO76075 338 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 TMEM50AO95807 157 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 IFNA10P01566 189 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 DEFA4P12838 97 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 M6PRP20645 277 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 RPL12P30050 165 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 S100A10P60903 97 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP4.87□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 GNB1P62873 340 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 NDPQ00604 133 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 RUNX1Q01196 453 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 VWC2Q2TAL6 325 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 FAM74A1Q5RGS3 127 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 ASPHD1Q5U4P2 390 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 TMEM252Q8N6L7 170 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 OR10P1Q8NGE3 313 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 OR10W1Q8NGF6 305 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 LINC01006Q8NI28 216 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 UBE2E2Q96LR5 201 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 HSPB9Q9BQS6 159 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 CDIP1Q9H305 208 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 PARP11Q9NR21 331 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 PSMB11A5LHX3 300 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 C15orf62A8K5M9 175 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 PMS2P5A8MQ11 134 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 NUDT19A8MXV4 375 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRR-207ENST00000548220 PRSS46E5RG02 174 aa4.86□□□□□ -1.63
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