RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 PLXNA2O75051 1894 aa-2.86□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa-2.87□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 PQLC2LA1A4F0 135 aa-2.87□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 GOLGA8RI6L899 631 aa-2.87□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP-2.87□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 XRCC2O43543 280 aa-2.87□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP-2.87□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 IGF2P01344 180 aa-2.87□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 MX1P20591 662 aa-2.87□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 GCHFRP30047 84 aa-2.87□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 TAS2R60P59551 318 aa-2.87□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 HERVK_113P63121 156 aa-2.87□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 TOMM20Q15388 145 aa-2.87□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 C8orf74Q6P047 294 aa-2.87□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 CSAG1Q6PB30 78 aa-2.87□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR8D4Q8NGM9 314 aa-2.87□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR13D1Q8NGV5 346 aa-2.87□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 MT1LQ93083 61 aa-2.87□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP-2.87□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 SDF2Q99470 211 aa-2.87□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM43Q9BTV4 400 aa-2.87□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 PBOV1Q9GZY1 135 aa-2.87□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa-2.87□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 MID1IP1Q9NPA3 183 aa-2.87□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP-2.87□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 PSME2Q9UL46 239 aa-2.87□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP-2.87□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYO15BQ96JP2 1530 aa-2.88□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa-2.88□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 PCP4L1A6NKN8 68 aa-2.88□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 C9JAW5 83 aa-2.88□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 HUS1O60921 280 aa-2.88□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 S100A7P31151 101 aa-2.88□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP-2.88□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP-2.88□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP-2.88□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP-2.88□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP-2.88□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM78BQ5VT40 261 aa-2.88□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 Q8IYB0 196 aa-2.88□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR52L1Q8NGH7 329 aa-2.88□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR4A15Q8NGL6 344 aa-2.88□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAB2BQ8WUD1 216 aa-2.88□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 C8orf44Q96CB5 159 aa-2.88□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa-2.88□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRELID1Q9Y255 219 aa-2.88□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADAMTS12P58397 1594 aa-2.88□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa-2.89□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP-2.89□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 PTPN23Q9H3S7 1636 aa-2.89□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP-2.89□□□□□ -2.87
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RNU6-172P-201ENST00000411000 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP-2.89□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 MRASO14807 208 aa-2.89□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 CST1P01037 141 aa-2.89□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYL2P10916 166 aa-2.89□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 TNNI1P19237 187 aa-2.89□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP-2.89□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 CASQ1P31415 396 aa-2.89□□□□□ -2.87
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RNU6-172P-201ENST00000411000 SCGB2A2Q13296 93 aa-2.89□□□□□ -2.87
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RNU6-172P-201ENST00000411000 CTSL3PQ5NE16 218 aa-2.89□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa-2.89□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa-2.89□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 SLC35D2Q76EJ3 337 aa-2.89□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR2W3Q7Z3T1 314 aa-2.89□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 CLHC1Q8NHS4 586 aa-2.89□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANP32EQ9BTT0 268 aa-2.89□□□□□ -2.87
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RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM242Q9NWH2 141 aa-2.89□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 EMC3Q9P0I2 261 aa-2.89□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 HECW2Q9P2P5 1572 aa-2.89□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 IL19Q9UHD0 177 aa-2.89□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 FAM135BQ49AJ0 1406 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 I3L2K1 104 aa-2.9□□□□□ -2.87
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RNU6-172P-201ENST00000411000 CYTH3O43739 400 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 IFNW1P05000 195 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 PSMA5P28066 241 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 RAB13P51153 203 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM33P57088 247 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 EMX2Q04743 252 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 BAXQ07812 192 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 BRMS1LQ5PSV4 323 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 CLEC6AQ6EIG7 209 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 GDPD1Q8N9F7 314 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR10K1Q8NGX5 313 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 COPS4Q9BT78 406 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 GGACTQ9BVM4 153 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 SNX10Q9Y5X0 201 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 KNDC1Q76NI1 1749 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 ATP8B3O60423 1300 aa-2.91□□□□□ -2.87
RNU6-172P-201ENST00000411000 OR2AG2A6NM03 316 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-172P-201ENST00000411000 HIGD1CA8MV81 97 aa-2.91□□□□□ -2.88
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