RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362858.1

RNU6-655P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 655, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-655P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-655P-201ENST00000362858 DEFA3P59666 94 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 ELOBQ15370 118 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 DPPA3Q6W0C5 159 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 AAED1Q7RTV5 226 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 DEFB128Q7Z7B8 93 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 WFDC11Q8NEX6 87 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 OR5A1Q8NGJ0 315 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 MBD3L1Q8WWY6 194 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 CEP19Q96LK0 163 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 Q96M85 177 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 GINS4Q9BRT9 223 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 OSTCQ9NRP0 149 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 IL20Q9NYY1 176 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 TOPBP1Q92547 1522 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 FN1P02751 2386 aaKnown RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 SMARCA4P51532 1647 aa0.92□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 STRCP1A6NGW2 1772 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 HECW1Q76N89 1606 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 TRAV4A0A0B4J268 109 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 A0A0D9SG52 128 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 CLDN25C9JDP6 229 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 F8W036 122 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 J3QRK9 145 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 TCL1BO95988 128 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 C1QBP02746 253 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 RPSAP08865 295 aaKnown RBP0.91□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 UBBP0CG47 229 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 COX6A1P12074 109 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 SERPINB9P50453 376 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP0.91□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF846Q147U1 533 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF826PQ6ZT77 177 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP0.91□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 C10orf126Q8N4M7 172 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF563Q8TA94 476 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 GPR146Q96CH1 333 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP0.91□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMEM133Q9H2Q1 129 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 MIXL1Q9H2W2 232 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 PTPRSQ13332 1948 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-655P-201ENST00000362858 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 TRBV19A0A075B6N1 114 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 CRPP02741 224 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 OR4E1P0C645 316 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 SPI1P17947 270 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 ATP5G3P48201 142 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 NUMA1Q14980 2115 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 RHEBQ15382 184 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 KHDC3LQ587J8 217 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 OR4E2Q8NGC2 313 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 OR8D4Q8NGM9 314 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 WFDC5Q8TCV5 224 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 AP3S1Q92572 193 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 STOML2Q9UJZ1 356 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 EPDR1Q9UM22 224 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 MAST2Q6P0Q8 1798 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 RIC1Q4ADV7 1423 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 GBF1Q92538 1859 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 A0A087X0T9 212 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 C1orf196B1AJZ1 125 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 OR5F1O95221 314 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 PRB1P04280 392 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 S100A5P33763 92 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 PPP1R2P41236 205 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 PIGPP57054 158 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 RRN3P1Q2M238 152 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 LYRM7Q5U5X0 104 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 LYG2Q86SG7 212 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 OR4D11Q8NGI4 311 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 OR13D1Q8NGV5 346 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 FAM172AQ8WUF8 416 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 AQP3Q92482 292 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 HIST1H2BLQ99880 126 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 TAS2R4Q9NYW5 299 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 PYCARDQ9ULZ3 195 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 RTTNQ86VV8 2226 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 SORL1Q92673 2214 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 GREB1Q4ZG55 1949 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 SETD5Q9C0A6 1442 aa0.89□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 PTPRBP23467 1997 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMEM212A6NML5 194 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 TMEM238C9JI98 176 aa0.88□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP0.88□□□□□ -2.27
RNU6-655P-201ENST00000362858 CYB5BO43169 146 aa0.88□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms