RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516042.1

RNU6-772P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 772, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-772P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-772P-201ENST00000516042 CAV3P56539 151 aa-2.36□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 SPAG11BQ08648 103 aa-2.36□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa-2.36□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 CASC2Q6XLA1 102 aa-2.36□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 OR5A1Q8NGJ0 315 aa-2.36□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 OR6N2Q8NGY6 317 aa-2.36□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 TEX47Q8TBZ9 253 aa-2.36□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 PPCDCQ96CD2 204 aa-2.36□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 GINS4Q9BRT9 223 aa-2.36□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 SLC39A9Q9NUM3 307 aa-2.36□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 KPTNQ9Y664 436 aa-2.36□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 RIC1Q4ADV7 1423 aa-2.36□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP-2.37□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 TAF1LQ8IZX4 1826 aa-2.37□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 ASS1P00966 412 aaKnown RBP-2.37□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 MBP02144 154 aa-2.37□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 RAB11BQ15907 218 aa-2.37□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa-2.37□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 ARHGAP18Q8N392 663 aa-2.37□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 GPX8Q8TED1 209 aa-2.37□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 SCGB3A1Q96QR1 104 aa-2.37□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP-2.37□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 IL36BQ9NZH7 164 aa-2.37□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 COMMD9Q9P000 198 aa-2.37□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP-2.37□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 CHD8Q9HCK8 2581 aa-2.38□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 PRORSD1PA6NEY8 169 aa-2.38□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 APOMO95445 188 aa-2.38□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 SNAP29O95721 258 aa-2.38□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 CASP1P29466 404 aa-2.38□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 FABP5Q01469 135 aa-2.38□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 OCIAD2Q56VL3 154 aa-2.38□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 KHDC3LQ587J8 217 aa-2.38□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa-2.38□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 GLT8D1Q68CQ7 371 aa-2.38□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 Q8N402 240 aa-2.38□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 OR4A15Q8NGL6 344 aa-2.38□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 Q96NJ1 140 aa-2.38□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 TP53RKQ96S44 253 aa-2.38□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 NT5C3AQ9H0P0 336 aa-2.38□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 GPR84Q9NQS5 396 aa-2.38□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP-2.38□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 C2CD3Q4AC94 2353 aa-2.38□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 DHFRP00374 187 aa-2.39□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 PRM2P04554 102 aa-2.39□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 CASQ1P31415 396 aa-2.39□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 HPCAP84074 193 aa-2.39□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 CAVIN4Q5BKX8 364 aa-2.39□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 CCDC148Q8NFR7 591 aa-2.39□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 GLYATL2Q8WU03 294 aa-2.39□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 BBS2Q9BXC9 721 aa-2.39□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP-2.39□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 SLC22A4Q9H015 551 aa-2.39□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 HRASLSQ9HDD0 168 aa-2.39□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa-2.39□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 UNC13BO14795 1591 aa-2.4□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 PQLC2LA1A4F0 135 aa-2.4□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 GP1BAP07359 652 aa-2.4□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 SRP19P09132 144 aaKnown RBP-2.4□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 COX7CP15954 63 aa-2.4□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 KCNJ3P48549 501 aa-2.4□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 H2BFSP57053 126 aa-2.4□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP-2.4□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 GLYATL3Q5SZD4 288 aa-2.4□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 C2orf82Q6UX34 121 aa-2.4□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa-2.4□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 KATNAL2Q8IYT4 538 aa-2.4□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 TMEM254Q8TBM7 123 aa-2.4□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 CYTH2Q99418 400 aa-2.4□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 CCDC77Q9BR77 488 aa-2.4□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa-2.4□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 SYT4Q9H2B2 425 aa-2.4□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 FBXO44Q9H4M3 255 aa-2.4□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 TMBIM4Q9HC24 238 aa-2.4□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 IFT46Q9NQC8 304 aa-2.4□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 EXTL2Q9UBQ6 330 aa-2.4□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 AK3Q9UIJ7 227 aa-2.4□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP-2.4□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa-2.4□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 TNS3Q68CZ2 1445 aa-2.41□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 MYH10P35580 1976 aa-2.41□□□□□ -2.79
RNU6-772P-201ENST00000516042 ATP5G1P05496 136 aa-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-772P-201ENST00000516042 LINC00301Q8NCQ3 95 aa-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-772P-201ENST00000516042 RMND1Q9NWS8 449 aa-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-772P-201ENST00000516042 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-772P-201ENST00000516042 V9GYY5 206 aaPredicted RBP-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-772P-201ENST00000516042 TANC1Q9C0D5 1861 aa-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-772P-201ENST00000516042 HECTD1Q9ULT8 2610 aa-2.41□□□□□ -2.8
RNU6-772P-201ENST00000516042 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-772P-201ENST00000516042 hCG_2039718K7EN88 272 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-772P-201ENST00000516042 TYMSP04818 313 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-772P-201ENST00000516042 DLX6P56179 175 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-772P-201ENST00000516042 STX3Q13277 289 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-772P-201ENST00000516042 EBPQ15125 230 aaKnown RBP-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-772P-201ENST00000516042 EXOC3L4Q17RC7 722 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-772P-201ENST00000516042 COMMD1Q8N668 190 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-772P-201ENST00000516042 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-772P-201ENST00000516042 PARVAQ9NVD7 372 aa-2.42□□□□□ -2.8
RNU6-772P-201ENST00000516042 SPTA1P02549 2419 aa-2.42□□□□□ -2.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms