RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 COL8A1P27658 744 aa10.55□□□□□ -0.72
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RABGEF1-211ENST00000503687 VENTXO95231 258 aa10.55□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
RABGEF1-211ENST00000503687 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
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RABGEF1-211ENST00000503687 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-211ENST00000503687 REC114Q7Z4M0 266 aa10.5□□□□□ -0.73
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RABGEF1-211ENST00000503687 K7EM74 188 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-211ENST00000503687 SCGB2A1O75556 95 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-211ENST00000503687 LCN2P80188 198 aa10.5□□□□□ -0.73
RABGEF1-211ENST00000503687 PNKDQ8N490 385 aa10.5□□□□□ -0.73
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