RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 HAX1O00165 279 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 CTLA4P16410 223 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 YPEL4Q96NS1 127 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 CACNA1FO60840 1977 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 BICRAQ9NZM4 1560 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 SLX4Q8IY92 1834 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 F2Z2F3 143 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 YPEL1O60688 119 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 KISS1Q15726 138 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 C2orf83Q53S99 150 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 UFSP1Q6NVU6 142 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 RNF152Q8N8N0 203 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 YPEL2Q96QA6 119 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 KNL1Q8NG31 2342 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1B0GUT8 65 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 NPIPB6E9PJ23 425 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 FKBP1BP68106 108 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 C4orf26Q17RF5 130 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 TEPPQ6URK8 271 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 MROH2AA6NES4 1674 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 SMIM26A0A096LP01 95 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 GNB1P62873 340 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 EBLN2Q6P2I7 272 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 ORMDL3Q8N138 153 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 PRDM14Q9GZV8 571 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 GTF3C1Q12789 2109 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 MYBPHLA2RUH7 354 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 CCL21O00585 134 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 IGHG1P01857 330 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 CTGFP29279 349 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 LEPP41159 167 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 TNFRSF4P43489 277 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 PILRAQ9UKJ1 303 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 TECPR2O15040 1411 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 BUB3O43684 328 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 FSTP19883 344 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 LY96Q9Y6Y9 160 aa4.65□□□□□ -1.66
PTPRC-209ENST00000442510 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 C9JCJ5 164 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 SPINT2O43291 252 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 IGHG2P01859 326 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 COX7CP15954 63 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 TIRAPP58753 221 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 PAXXQ9BUH6 204 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 A0A087WX48 190 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 TRAV41A0A0B4J266 112 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 TRAV4A0A0B4J268 109 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 LMO1P25800 156 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 VWC2Q2TAL6 325 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 LGALS9BQ3B8N2 356 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 LGALS9CQ6DKI2 356 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 SPEM1Q8N4L4 309 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF525Q8N782 197 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM230Q96A57 120 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 IFI27L2Q9H2X8 130 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 MS4A18H0YCH9 400 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 DUTP33316 252 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 C1orf100Q5SVJ3 147 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 GTSF1Q8WW33 167 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 SCRT1Q9BWW7 348 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 RNF186Q9NXI6 227 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 PREX1Q8TCU6 1659 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 FAM90A26D6RGX4 464 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 F6UB75 175 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 CCL11P51671 97 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 PFN3P60673 137 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 IL15RAQ13261 267 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 C1orf61Q13536 156 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 DEFB134Q4QY38 66 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 FOXB1Q99853 325 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 TM2D2Q9BX73 214 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 CCL28Q9NRJ3 127 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 C4AP0C0L4 1744 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 C4BP0C0L5 1744 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 TET3O43151 1660 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 E9PQ18 207 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 FXYD2P54710 66 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 TCF15Q12870 199 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 SPRYD7Q5W111 196 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 ZNRF2Q8NHG8 242 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 DYNLRB2Q8TF09 96 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 RNF138Q8WVD3 245 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 IGFBPL1Q8WX77 278 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRC-209ENST00000442510 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
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