RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 ERHP84090 104 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM187Q14656 261 aa5.83□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 LCE2CQ5TA81 110 aa5.83□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 LCN12Q6JVE5 192 aa5.83□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 NOXA1Q86UR1 476 aa5.83□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 SLC35G3Q8N808 338 aa5.83□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 LRTM2Q8N967 370 aa5.83□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 OR52E5Q8NH55 327 aa5.83□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 ENKURQ8TC29 256 aa5.83□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 GLYATL2Q8WU03 294 aa5.83□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 CXorf58Q96LI9 332 aa5.83□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC140Q96MF4 163 aa5.83□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 PLEKHA3Q9HB20 300 aa5.83□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa5.83□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa5.83□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 TMED3Q9Y3Q3 217 aa5.83□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 S4R3C0 116 aa5.83□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1B0GU03 582 aa5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 MFSD2BA6NFX1 497 aa5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 INS-IGF2F8WCM5 200 aa5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 PLA2G10O15496 165 aa5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 GGCTO75223 188 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 SCGB2A1O75556 95 aa5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 NDUFB8O95169 186 aa5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 IFNA21P01568 189 aa5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 IFNA17P01571 189 aa5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 IGKV1-39P01597 117 aa5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 IGKV1D-39P04432 117 aa5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 P0C879 139 aa5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 SULT1A3P0DMM9 295 aa5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 SULT1A4P0DMN0 295 aa5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 SLC25A6P12236 298 aa5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 ARL3P36405 182 aa5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 SNCAP37840 140 aa5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 SPCS3P61009 180 aa5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 PRCDQ00LT1 54 aa5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 IFITM3Q01628 133 aa5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 KLK9Q2XQG4 91 aa5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 SP6Q3SY56 376 aa5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 AARDQ4LEZ3 155 aa5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 C4orf46Q504U0 113 aa5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 CLEC19AQ6UXS0 136 aa5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 GTSCR1Q86UQ5 136 aa5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 OR10W1Q8NGF6 305 aa5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM230Q96A57 120 aa5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 ATP6V0BQ99437 205 aa5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 HINT2Q9BX68 163 aa5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 C20orf85Q9H1P6 137 aa5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 KLK9Q9UKQ9 250 aa5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 DMRT1Q9Y5R6 373 aa5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 STARD9Q9P2P6 4700 aa5.82□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa5.81□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa5.81□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 A0A0B4J293 547 aa5.81□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 IZUMO1RA6ND01 250 aa5.81□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 FAM90A26D6RGX4 464 aa5.81□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 CORTO00230 105 aa5.81□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 OR2C1O95371 312 aa5.81□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 SFT2D2O95562 160 aa5.81□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 IGKV1-5P01602 117 aa5.81□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 TCRBP04435 133 aa5.81□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 OR4E1P0C645 316 aa5.81□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 OR13C7P0DN81 318 aa5.81□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 WT1-ASQ06250 92 aa5.81□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 PPP1R1AQ13522 171 aa5.81□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 SMCO1Q147U7 214 aa5.81□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 LYG2Q86SG7 212 aa5.81□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 SBSPONQ8IVN8 264 aa5.81□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 Q8N1Y9 231 aa5.81□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF114Q8NC26 417 aa5.81□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 OR2K2Q8NGT1 345 aa5.81□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 OR1P1Q8NH06 330 aa5.81□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 DYNLRB2Q8TF09 96 aa5.81□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 RCHY1Q96PM5 261 aa5.81□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 HIPK2Q9H2X6 1198 aa5.81□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 PALMDQ9NP74 551 aa5.81□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 NUDT15Q9NV35 164 aa5.81□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 CACNG5Q9UF02 275 aa5.81□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 C9orf170A2RU37 121 aa5.8□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 C2orf70A6NJV1 201 aa5.8□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 A8MWP6 167 aa5.8□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 LGALS9O00182 355 aa5.8□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 ST8SIA3O43173 380 aa5.8□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 PRAF2O60831 178 aa5.8□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 MED6O75586 246 aa5.8□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 H2AFB2P0C5Z0 115 aa5.8□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 FOLR2P14207 255 aa5.8□□□□□ -1.48
SGMS1-201ENST00000361543 EDN2P20800 178 aa5.8□□□□□ -1.48
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