RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559357.5

USP3-AS1-202, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 455 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-202ENST00000559357 OPN1MW3P0DN78 364 aa4.36□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 LYL1P12980 280 aa4.36□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 CNTFRP26992 372 aa4.36□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 MC5RP33032 325 aa4.36□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 P2RY1P47900 373 aa4.36□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 RAB13P51153 203 aa4.36□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 TNFRSF9Q07011 255 aa4.36□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR2F1Q13607 317 aa4.36□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 HES1Q14469 280 aa4.36□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 HNF4GQ14541 408 aa4.36□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 BRD3OSQ6XYD6 125 aa4.36□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa4.36□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa4.36□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 DYNAPQ8N1N2 210 aa4.36□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 DTD1Q8TEA8 209 aa4.36□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 C17orf50Q8WW18 174 aa4.36□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa4.36□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 CLCC1Q96S66 551 aa4.36□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 ARPC5LQ9BPX5 153 aa4.36□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 REG4Q9BYZ8 158 aa4.36□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLA2Q9H6Q3 261 aa4.36□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 MAP6D1Q9H9H5 199 aa4.36□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 HIF1ANQ9NWT6 349 aa4.36□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 PSENENQ9NZ42 101 aa4.36□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 DPM3Q9P2X0 92 aa4.36□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR51B2Q9Y5P1 312 aa4.36□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 AUP1Q9Y679 476 aa4.36□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 CHD6Q8TD26 2715 aa4.36□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 A0A087WYN8 130 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 A0A096LNT2 108 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 C15orf61A6NNL5 157 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 UPK2O00526 184 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 NPFFO15130 113 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 MED6O75586 246 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 CST7O76096 145 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 KBTBD11O94819 623 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMEM50AO95807 157 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 CFDP00746 253 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 TGFAP01135 160 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 IGKV1D-33P01593 117 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 IGKV1-33P01594 117 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 METTL15P1P0C7V9 234 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 SAA4P35542 130 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 UBE2E1P51965 193 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 PAX9P55771 341 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 UBE2KP61086 200 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 GNB1P62873 340 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 PAX8Q06710 450 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 ZNF345Q14585 488 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 CLINT1Q14677 625 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 PLGLAQ15195 96 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 VMA21Q3ZAQ7 101 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 SPANXN5Q5MJ07 72 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR8H3Q8N146 312 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR2C3Q8N628 320 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMEM217Q8N7C4 229 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 OR4C13Q8NGP0 309 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 AQP10Q96PS8 301 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 RAB40CQ96S21 281 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 GON7Q9BXV9 100 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 SLC25A31Q9H0C2 315 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 C11orf1Q9H5F2 150 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 ENY2Q9NPA8 101 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 COA4Q9NYJ1 87 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 HSPB7Q9UBY9 170 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 FBXL17Q9UF56 701 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 TCF19Q9Y242 345 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa4.35□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 AKAP6Q13023 2319 aa4.34□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 CSMD2Q7Z408 3487 aa4.34□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa4.34□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa4.34□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 FAM90A26D6RGX4 464 aa4.34□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 VENTXO95231 258 aa4.34□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 IGKV3-20P01619 116 aa4.34□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 IGLV2-23P01705 113 aa4.34□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 IGHV1-69P01742 117 aa4.34□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 IGHV4-31P0DP07 118 aa4.34□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 TMEM11P17152 192 aa4.34□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 DYNLT3P51808 116 aa4.34□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 SPCS3P61009 180 aa4.34□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 UBA52P62987 128 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 PJVKQ0ZLH3 352 aa4.34□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 PSG5Q15238 335 aa4.34□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 MMDQ15546 238 aa4.34□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 TNXAQ16473 311 aa4.34□□□□□ -1.71
USP3-AS1-202ENST00000559357 POU2AF1Q16633 256 aa4.34□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.7 ms