RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490813.5

CEP170-216, Transcript of centrosomal protein 170, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CEP170, Length 1,070 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CEP170-216	ENST00000490813	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	FGF2	P09038	288 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	CD36	P16671	472 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	GNGT1	P63211	74 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	PLA2G7	Q13093	441 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813		Q5VSD8	79 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	KCTD9	Q7L273	389 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	OR4S2	Q8NH73	311 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	SMIM19	Q96E16	107 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	4.02	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	RNF2	Q99496	336 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	NEU1	Q99519	415 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	SLC29A1	Q99808	456 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	TM2D1	Q9BX74	207 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813		Q9N2K0	584 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	TMEM140	Q9NV12	185 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	AP4S1	Q9Y587	144 aa		4.02	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	4.02	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813		A0A1W2PS18	150 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	IRGM	A1A4Y4	181 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	SMIM30	A4D0T7	59 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	CHEK1	O14757	476 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	OGG1	O15527	345 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	ATP8B1	O43520	1251 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	RPA2	P15927	270 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	GABRB1	P18505	474 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	CEL	P19835	753 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	DCK	P27707	260 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	TFPI2	P48307	235 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	CCL18	P55774	89 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	DEFB131A	P59861	70 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	GINS4	Q9BRT9	223 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		4.01	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	OR2T8	A6NH00	312 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	BET1	O15155	118 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	FABP7	O15540	132 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	FCGR3B	O75015	233 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	IFNA5	P01569	189 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	ALPL	P05186	524 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	CDK1	P06493	297 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	AREG	P15514	252 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	HLA-G	P17693	338 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	CRHBP	P24387	322 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	HTR2C	P28335	458 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	ALDH3B2	P48448	385 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	EIF2B2	P49770	351 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	TAS2R43	P59537	309 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	TCF24	Q7RTU0	167 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	CADM3	Q8N126	398 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	OR10C1	Q96KK4	312 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	BET1L	Q9NYM9	111 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	AK3	Q9UIJ7	227 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	CELA1	Q9UNI1	258 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813		S4R3C0	116 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	FAT1	Q14517	4588 aa		4	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813		A0A1W2PPQ1	181 aa		3.99	□□□□□ -1.77
CEP170-216	ENST00000490813	LINC00473	A8K010	186 aa		3.99	□□□□□ -1.77

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