RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 LEMD1Q68G75 181 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRM-201ENST00000332175 C2orf88Q9BSF0 95 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRM-201ENST00000332175 CBLN4Q9NTU7 201 aa18.77■□□□□ 0.6
PTPRM-201ENST00000332175 MYOFQ9NZM1 2061 aa18.77■□□□□ 0.59
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PTPRM-201ENST00000332175 SCGB3A1Q96QR1 104 aa18.77■□□□□ 0.59
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PTPRM-201ENST00000332175 OR11H2Q8NH07 326 aa18.73■□□□□ 0.59
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PTPRM-201ENST00000332175 TMEM250H0YL14 139 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRM-201ENST00000332175 RHOGP84095 191 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRM-201ENST00000332175 OR10J3Q5JRS4 329 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRM-201ENST00000332175 HOXA5P20719 270 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRM-201ENST00000332175 LRTM2Q8N967 370 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRM-201ENST00000332175 FAM131CQ96AQ9 280 aa18.67■□□□□ 0.58
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