RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF491Q8N8L2 437 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF485Q8NCK3 441 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 OR11H1Q8NG94 326 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 OR1N2Q8NGR9 330 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 OR10AC1Q8NH08 325 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 OR4S2Q8NH73 311 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 CT45A3Q8NHU0 189 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 C15orf40Q8WUR7 153 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 APH1BQ8WW43 257 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 ARPC1AQ92747 370 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 MARC2Q969Z3 335 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 ISOC1Q96CN7 298 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 RAB3CQ96E17 227 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 CXorf58Q96LI9 332 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 FAM218AQ96MZ4 157 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 UHRF2Q96PU4 802 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 LITAFQ99732 161 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 NABP2Q9BQ15 211 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 GINS4Q9BRT9 223 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 CABLES2Q9BTV7 478 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 ANKRD60Q9BZ19 345 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 PARP11Q9NR21 331 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 FKBP14Q9NWM8 211 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 SLC2A8Q9NY64 477 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 SIGLEC9Q9Y336 463 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 ETV7Q9Y603 341 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 V9GY05 133 aa3.22□□□□□ -1.89
HDAC2-216ENST00000523628 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 TRAV25A0A0B4J276 109 aa3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 SNURFLB1AK76 121 aa3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 H0YJW9 148 aa3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 DENRO43583 198 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 SAP30O75446 220 aa3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 B3GALNT1O75752 331 aa3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 MMP23AO75900 390 aa3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 CALCBP10092 127 aa3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 RAB3BP20337 219 aa3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 CEACAM6P40199 344 aa3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 RAB25P57735 213 aa3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 TPPP2P59282 170 aa3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 ARFRP1Q13795 201 aa3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 OR2G6Q5TZ20 316 aa3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 LPCAT3Q6P1A2 487 aa3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 PET117Q6UWS5 81 aa3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 SLC16A13Q7RTY0 426 aa3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 CEACAM19Q7Z692 300 aa3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF645Q8N7E2 425 aa3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 NECAP1Q8NC96 275 aa3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 OR10K1Q8NGX5 313 aa3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 OR4K15Q8NH41 348 aa3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 RFESDQ8TAC1 157 aa3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 IL1F10Q8WWZ1 152 aa3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 GGHQ92820 318 aa3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 ABHD14BQ96IU4 210 aa3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 TSC22D3Q99576 134 aa3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 DUSP21Q9H596 190 aa3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 AMBNQ9NP70 447 aa3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 PLSCR3Q9NRY6 295 aa3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 NDUFB11Q9NX14 153 aa3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 FKBP11Q9NYL4 201 aa3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 RAB26Q9ULW5 256 aa3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 RABL2BQ9UNT1 228 aa3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 STAB2Q8WWQ8 2551 aa3.21□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa3.2□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa3.2□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa3.2□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF320A2RRD8 509 aa3.2□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 IFITM5A6NNB3 132 aa3.2□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 K7EIL1 84 aa3.2□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 LGALS9O00182 355 aa3.2□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 FABP7O15540 132 aa3.2□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 TFF1P04155 84 aa3.2□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 PRSS1P07477 247 aa3.2□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 OR9G9P0C7N8 305 aa3.2□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 GP9P14770 177 aa3.2□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 S100A7P31151 101 aa3.2□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
HDAC2-216ENST00000523628 VEGFCP49767 419 aa3.2□□□□□ -1.9
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