RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 ESM1Q9NQ30 184 aa9.26□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa9.26□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 GSKIPQ9P0R6 139 aa9.26□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 TRAV3A0A0B4J244 114 aa9.25□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 MPTX1A8MV57 137 aa9.25□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 AP4M1O00189 453 aa9.25□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 WRBO00258 174 aa9.25□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 FCN1O00602 326 aa9.25□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 CCSO14618 274 aa9.25□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 CYB5BO43169 146 aa9.25□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 SYNGR2O43760 224 aa9.25□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 CXCL3P19876 107 aa9.25□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 TAS2R30P59541 319 aa9.25□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 OR2B8PP59922 312 aa9.25□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 RPP30P78346 268 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 PJVKQ0ZLH3 352 aa9.25□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 C2orf68Q2NKX9 166 aa9.25□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 AKIRIN2Q53H80 203 aa9.25□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 OR1L6Q8NGR2 347 aa9.25□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 RAB40CQ96S21 281 aa9.25□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 HIPK2Q9H2X6 1198 aa9.25□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 C16orf95Q9H693 158 aa9.25□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 PLEKHA3Q9HB20 300 aa9.25□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 TPSG1Q9NRR2 321 aa9.25□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 NSG2Q9Y328 171 aa9.25□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 FAM181BA6NEQ2 426 aa9.24□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 NDUFA7O95182 113 aa9.24□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 PSMB6P28072 239 aa9.24□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 GNB1P62873 340 aa9.24□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 ERHP84090 104 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa9.24□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 OR2T6Q8NHC8 308 aa9.24□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 TNFRSF19Q9NS68 423 aa9.24□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 A0A1B0GUS0 222 aa9.23□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 MSGN1A6NI15 193 aa9.23□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 NPIPB5A8MRT5 1133 aa9.23□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 CEBPZOSA8MTT3 80 aa9.23□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 BRI3O95415 125 aa9.23□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 SIX6O95475 246 aa9.23□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 MBPP02686 304 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP9.23□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 BLCAPP62952 87 aa9.23□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 AWAT1Q58HT5 328 aa9.23□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 DTD1Q8TEA8 209 aa9.23□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa9.23□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 HSPB9Q9BQS6 159 aa9.23□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 ZNF702PQ9H963 129 aa9.23□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 WSB1Q9Y6I7 421 aa9.23□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 U3KQ87 197 aa9.23□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 TEX22C9J3V5 150 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 E5RGE8 158 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 H3BUA1 57 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 CCNKO75909 580 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 CRYGCP07315 174 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 SNCAP37840 140 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 HTR2BP41595 481 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 C9orf152Q5JTZ5 239 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 PRR31Q5SQ13 230 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 AKAP14Q86UN6 197 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 TCTE3Q8IZS6 198 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 TTC9CQ8N5M4 171 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 COMMD1Q8N668 190 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 ZNF114Q8NC26 417 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 GRPEL2Q8TAA5 225 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 THAP6Q8TBB0 222 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 ABHD5Q8WTS1 349 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 SMIM8Q96KF7 97 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 RBKSQ9H477 322 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 PARP11Q9NR21 331 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 CMYA5Q8N3K9 4069 aa9.22□□□□□ -0.93
NISCH-211ENST00000488243 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa9.21□□□□□ -0.94
NISCH-211ENST00000488243 TRAV41A0A0B4J266 112 aa9.21□□□□□ -0.94
NISCH-211ENST00000488243 A0A1B0GVG6 124 aa9.21□□□□□ -0.94
NISCH-211ENST00000488243 IGLC7A0M8Q6 106 aa9.21□□□□□ -0.94
NISCH-211ENST00000488243 CGB1A6NKQ9 187 aa9.21□□□□□ -0.94
NISCH-211ENST00000488243 K7EPK0 472 aa9.21□□□□□ -0.94
NISCH-211ENST00000488243 L7N2F9 121 aa9.21□□□□□ -0.94
NISCH-211ENST00000488243 CORTO00230 105 aa9.21□□□□□ -0.94
NISCH-211ENST00000488243 ATP6V0E1O15342 81 aa9.21□□□□□ -0.94
NISCH-211ENST00000488243 TSC22D2O75157 780 aa9.21□□□□□ -0.94
NISCH-211ENST00000488243 DEDDO75618 318 aa9.21□□□□□ -0.94
NISCH-211ENST00000488243 MPC2O95563 127 aa9.21□□□□□ -0.94
NISCH-211ENST00000488243 SCGB1D2O95969 90 aa9.21□□□□□ -0.94
NISCH-211ENST00000488243 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
NISCH-211ENST00000488243 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
NISCH-211ENST00000488243 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
NISCH-211ENST00000488243 VAMP2P63027 116 aa9.21□□□□□ -0.94
NISCH-211ENST00000488243 SLC35B1P78383 322 aa9.21□□□□□ -0.94
NISCH-211ENST00000488243 RAB32Q13637 225 aa9.21□□□□□ -0.94
NISCH-211ENST00000488243 KLK9Q2XQG4 91 aa9.21□□□□□ -0.94
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