RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261799.8

PDGFRB-201, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFRB, Length 5,717 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-201ENST00000261799 F5P12259 2224 aa11.36□□□□□ -0.59
PDGFRB-201ENST00000261799 RRHO14718 337 aa11.36□□□□□ -0.59
PDGFRB-201ENST00000261799 ARL14EPLP0DKL9 152 aa11.36□□□□□ -0.59
PDGFRB-201ENST00000261799 PMS2P11Q13670 270 aa11.36□□□□□ -0.59
PDGFRB-201ENST00000261799 OR11H4Q8NGC9 324 aa11.36□□□□□ -0.59
PDGFRB-201ENST00000261799 WFDC6Q9BQY6 131 aa11.36□□□□□ -0.59
PDGFRB-201ENST00000261799 TRGV11A0A075B6L2 103 aa11.36□□□□□ -0.59
PDGFRB-201ENST00000261799 C1QL1O75973 258 aa11.36□□□□□ -0.59
PDGFRB-201ENST00000261799 PAX8Q06710 450 aa11.36□□□□□ -0.59
PDGFRB-201ENST00000261799 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
PDGFRB-201ENST00000261799 OR5AN1Q8NGI8 311 aa11.36□□□□□ -0.59
PDGFRB-201ENST00000261799 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
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PDGFRB-201ENST00000261799 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa11.36□□□□□ -0.59
PDGFRB-201ENST00000261799 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa11.36□□□□□ -0.59
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PDGFRB-201ENST00000261799 TM2D1Q9BX74 207 aa11.36□□□□□ -0.59
PDGFRB-201ENST00000261799 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa11.35□□□□□ -0.59
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PDGFRB-201ENST00000261799 NPIPB7O75200 414 aa11.35□□□□□ -0.59
PDGFRB-201ENST00000261799 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
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PDGFRB-201ENST00000261799 OR10S1Q8NGN2 331 aa11.35□□□□□ -0.59
PDGFRB-201ENST00000261799 TBX15Q96SF7 602 aa11.35□□□□□ -0.59
PDGFRB-201ENST00000261799 ALX3O95076 343 aa11.35□□□□□ -0.59
PDGFRB-201ENST00000261799 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa11.35□□□□□ -0.59
PDGFRB-201ENST00000261799 ZNF600Q6ZNG1 722 aa11.35□□□□□ -0.59
PDGFRB-201ENST00000261799 CD24P25063 80 aa11.35□□□□□ -0.59
PDGFRB-201ENST00000261799 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP11.35□□□□□ -0.59
PDGFRB-201ENST00000261799 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa11.35□□□□□ -0.59
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PDGFRB-201ENST00000261799 WBP1Q96G27 269 aa11.35□□□□□ -0.59
PDGFRB-201ENST00000261799 TMEM219Q86XT9 240 aa11.34□□□□□ -0.59
PDGFRB-201ENST00000261799 Q71RC1 249 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
PDGFRB-201ENST00000261799 TCF24Q7RTU0 167 aa11.34□□□□□ -0.59
PDGFRB-201ENST00000261799 GGNQ86UU5 652 aa11.34□□□□□ -0.59
PDGFRB-201ENST00000261799 BPESC1Q9GZL8 116 aa11.34□□□□□ -0.59
PDGFRB-201ENST00000261799 J3QLI3 93 aa11.34□□□□□ -0.59
PDGFRB-201ENST00000261799 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
PDGFRB-201ENST00000261799 NDUFB4O95168 129 aa11.34□□□□□ -0.59
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PDGFRB-201ENST00000261799 RUNX1Q01196 453 aa11.34□□□□□ -0.59
PDGFRB-201ENST00000261799 KLRD1Q13241 179 aa11.34□□□□□ -0.59
PDGFRB-201ENST00000261799 ZNF345Q14585 488 aa11.34□□□□□ -0.59
PDGFRB-201ENST00000261799 TMEM187Q14656 261 aa11.34□□□□□ -0.59
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PDGFRB-201ENST00000261799 IGFL3Q6UXB1 125 aa11.33□□□□□ -0.6
PDGFRB-201ENST00000261799 LCNL1Q6ZST4 164 aa11.33□□□□□ -0.6
PDGFRB-201ENST00000261799 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
PDGFRB-201ENST00000261799 F12P00748 615 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
PDGFRB-201ENST00000261799 TMEM155Q4W5P6 130 aa11.33□□□□□ -0.6
PDGFRB-201ENST00000261799 GPHA2Q96T91 129 aa11.33□□□□□ -0.6
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PDGFRB-201ENST00000261799 SCN5AQ14524 2016 aa11.33□□□□□ -0.6
PDGFRB-201ENST00000261799 H3BRM9 83 aa11.33□□□□□ -0.6
PDGFRB-201ENST00000261799 PLA2G5P39877 138 aa11.33□□□□□ -0.6
PDGFRB-201ENST00000261799 TMEM42Q69YG0 159 aa11.33□□□□□ -0.6
PDGFRB-201ENST00000261799 ASCL4Q6XD76 172 aa11.33□□□□□ -0.6
PDGFRB-201ENST00000261799 CROCCQ5TZA2 2017 aa11.33□□□□□ -0.6
PDGFRB-201ENST00000261799 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP11.33□□□□□ -0.6
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PDGFRB-201ENST00000261799 HIST1H2BAQ96A08 127 aa11.33□□□□□ -0.6
PDGFRB-201ENST00000261799 NIT2Q9NQR4 276 aa11.33□□□□□ -0.6
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PDGFRB-201ENST00000261799 LINC00114Q6XXX2 140 aa11.32□□□□□ -0.6
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PDGFRB-201ENST00000261799 C17orf98A8MV24 154 aa11.32□□□□□ -0.6
PDGFRB-201ENST00000261799 M0R381 172 aa11.32□□□□□ -0.6
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PDGFRB-201ENST00000261799 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
PDGFRB-201ENST00000261799 CACNG8Q8WXS5 425 aa11.32□□□□□ -0.6
PDGFRB-201ENST00000261799 ST6GAL2Q96JF0 529 aa11.32□□□□□ -0.6
PDGFRB-201ENST00000261799 AICDAQ9GZX7 198 aa11.32□□□□□ -0.6
PDGFRB-201ENST00000261799 P2RY4P51582 365 aa11.32□□□□□ -0.6
PDGFRB-201ENST00000261799 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa11.32□□□□□ -0.6
PDGFRB-201ENST00000261799 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
PDGFRB-201ENST00000261799 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
PDGFRB-201ENST00000261799 MORN2Q502X0 79 aa11.32□□□□□ -0.6
PDGFRB-201ENST00000261799 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa11.32□□□□□ -0.6
PDGFRB-201ENST00000261799 M0R143 59 aa11.32□□□□□ -0.6
PDGFRB-201ENST00000261799 EREGO14944 169 aa11.32□□□□□ -0.6
PDGFRB-201ENST00000261799 IGHV1-8P0DP01 117 aa11.32□□□□□ -0.6
PDGFRB-201ENST00000261799 FAM24BQ8N5W8 94 aa11.32□□□□□ -0.6
PDGFRB-201ENST00000261799 FUT9Q9Y231 359 aa11.32□□□□□ -0.6
PDGFRB-201ENST00000261799 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa11.31□□□□□ -0.6
PDGFRB-201ENST00000261799 A6NJY4 79 aa11.31□□□□□ -0.6
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