RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582376.1

GGA3-212, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 551 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-212ENST00000582376 AK3Q9UIJ7 227 aa6.48□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa6.47□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa6.47□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa6.47□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 SNTNA6NMZ2 147 aa6.47□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 CYB5BO43169 146 aa6.47□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 YIF1AO95070 293 aa6.47□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 IFNA5P01569 189 aa6.47□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 CD3GP09693 182 aa6.47□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 SRMP19623 302 aa6.47□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 CRHBPP24387 322 aa6.47□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 HTR2CP28335 458 aa6.47□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 CCL18P55774 89 aa6.47□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 OXA1LQ15070 435 aa6.47□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 TTC32Q5I0X7 151 aa6.47□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 FAM222AQ5U5X8 452 aa6.47□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 UBE2UQ5VVX9 321 aa6.47□□□□□ -1.37
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GGA3-212ENST00000582376 OR10K2Q6IF99 312 aa6.47□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 MFSD4AQ8N468 514 aa6.47□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 DUSP18Q8NEJ0 188 aa6.47□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 ZNF414Q96IQ9 312 aa6.47□□□□□ -1.37
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GGA3-212ENST00000582376 CIB1Q99828 191 aa6.47□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.47□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 TMEM59Q9BXS4 323 aa6.47□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 C21orf62Q9NYP8 219 aa6.47□□□□□ -1.37
GGA3-212ENST00000582376 DKK2Q9UBU2 259 aa6.47□□□□□ -1.37
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GGA3-212ENST00000582376 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa6.46□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 CGB1A6NKQ9 187 aa6.46□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 TRDCB7Z8K6 153 aa6.46□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 G3V2T6 193 aa6.46□□□□□ -1.38
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GGA3-212ENST00000582376 EREGO14944 169 aa6.46□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 BET1O15155 118 aa6.46□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 ST8SIA3O43173 380 aa6.46□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 GNB3P16520 340 aa6.46□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 KRTAP10-1P60331 282 aa6.46□□□□□ -1.38
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GGA3-212ENST00000582376 RELQ04864 619 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 Q499Y3 187 aa6.46□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 CCDC58Q4VC31 144 aa6.46□□□□□ -1.38
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GGA3-212ENST00000582376 XAF1Q6GPH4 301 aa6.46□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 GSG1LQ6UXU4 331 aa6.46□□□□□ -1.38
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GGA3-212ENST00000582376 OR10J5Q8NHC4 309 aa6.46□□□□□ -1.38
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GGA3-212ENST00000582376 OR10C1Q96KK4 312 aa6.46□□□□□ -1.38
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GGA3-212ENST00000582376 C12orf4Q9NQ89 552 aa6.46□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa6.46□□□□□ -1.38
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GGA3-212ENST00000582376 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa6.45□□□□□ -1.38
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GGA3-212ENST00000582376 CELP19835 753 aa6.45□□□□□ -1.38
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GGA3-212ENST00000582376 OR2B11Q5JQS5 317 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 SLC25A24Q6NUK1 477 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 SPATA24Q86W54 205 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 NKAIN3Q8N8D7 197 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 ST8SIA2Q92186 375 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 SMIM19Q96E16 107 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 GABARAPL3Q9BY60 117 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa6.45□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 Q9H8V8 135 aa6.45□□□□□ -1.38
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GGA3-212ENST00000582376 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
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GGA3-212ENST00000582376 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa6.44□□□□□ -1.38
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GGA3-212ENST00000582376 FABP7O15540 132 aa6.44□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 NUDT3O95989 172 aa6.44□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 OR2B8PP59922 312 aa6.44□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 DAD1P61803 113 aa6.44□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 IGSF11Q5DX21 431 aa6.44□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 KCTD9Q7L273 389 aa6.44□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 LILRB2Q8N423 598 aa6.44□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 OR4S2Q8NH73 311 aa6.44□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 SCARB1Q8WTV0 552 aa6.44□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 GRAMD2BQ96HH9 432 aa6.44□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
GGA3-212ENST00000582376 CABLES2Q9BTV7 478 aa6.44□□□□□ -1.38
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