RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000022224.15

Trappc13-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc13, Length 2,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Xrcc3Q9CXE6 349 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Mrps30Q9D0G0 442 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Lamtor5Q9D1L9 91 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Ube2v2Q9D2M8 145 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Prss37Q9DAA4 237 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Mmp1aQ9EPL5 464 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Fgf16Q9ESL8 207 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 LitafQ9JLJ0 161 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Elovl1Q9JLJ5 279 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Vstm2bQ9JME9 285 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Fbxw4Q9JMJ2 410 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Sdk2Q6V4S5 2176 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Ube2dnl2A2AFH2 155 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 MsmpB1AWI6 139 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Gm43517E9PYS1 339 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Ankrd65F6YK91 380 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Vmn1r167G3UW71 315 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 P04945 108 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 NrasP08556 189 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Sdc1P18828 311 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Gdf1P20863 357 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 FblP35550 327 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Rab1AP62821 205 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Supt4h1aP63271 117 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Gpr55Q3UJF0 327 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Gm6899Q3USS0 134 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Trat1Q3UU67 187 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 NmsQ5H8A1 153 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Scarb1Q61009 509 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Sys1Q78S06 156 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 ErasQ7TN89 227 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Olfr987Q7TRA2 309 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Zfp819Q80V81 607 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Cphx2Q8BX39 182 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Tssk5Q8C1R0 372 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Lyrm2Q8R033 88 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Mib2Q8R516 973 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Olfr1408Q8VG32 310 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 UmodQ91X17 642 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Ddb2Q99J79 432 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Nkx6-1Q99MA9 365 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Fbxo36Q9CQ24 188 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 ChodlQ9CXM0 273 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Q9DAE8 263 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 C1galt1c1Q9JMG2 316 aa6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Dnajb12Q9QYI4 376 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Fer1l4A3KGK3 1992 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Arid1aA2BH40 2283 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 2610044O15Rik8A0A087WRJ1 410 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Olfr455A0A0B4J1M2 317 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Gm45716A0A1B0GRQ0 93 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Gm45808A0A1B0GSH8 263 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Olfr267A2AM35 313 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Prrt2E9PUL5 346 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Gm21883J3QPV3 123 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Vmn2r60L7N2A1 853 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Ifitm5O88728 134 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 GzmbP04187 247 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Saa2P05367 122 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Ifna4P07351 186 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 DaoP18894 345 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Psg19Q4KL31 475 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Sdr39u1Q5M8N4 308 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Ifna15Q61718 190 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 BckdhbQ6P3A8 390 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Sat2Q6P8J2 170 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Ceacam9Q78T27 234 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Olfr1371Q7TQT7 311 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Olfr1290Q7TQX8 312 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Olfr890Q7TRD9 314 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Olfr876Q7TRE4 310 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Prss27Q8BJR6 328 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Galnt14Q8BVG5 550 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 1700001C19RikQ8K168 210 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Foxn4Q8K3Q3 521 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Slc37a1Q8R070 531 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Vmn1r8Q8R2C2 303 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Sco2Q8VCL2 255 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Olfr1384Q8VFA8 318 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Pth2Q91W27 100 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Gjc3Q921C1 269 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Dnaja3Q99M87 480 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Tm7sf3Q9CRG1 565 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Rcc1lQ9CYF5 461 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Mmp17Q9R0S3 578 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Actl6aQ9Z2N8 429 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Ighv1-76A0A0G2JFE9 117 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Olfr548-ps1A0A1B0GSG0 314 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Olfr1289A0A288CFY5 326 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 CenpfE9Q3P4 2997 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Vmn1r113G3UWI8 307 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Vmn1r204I7HIK1 302 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Gm21789J3QMZ1 123 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Gm21870J3QPN2 123 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 C3ar1O09047 477 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 P2rx6O54803 389 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Wnt2bO70283 389 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Ifna1P01572 189 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 P01795 144 aa6.75□□□□□ -1.33
Trappc13-201ENSMUST00000022224 Tdpoz1P0DMR5 365 aa6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34.3 ms