Protein–RNA interactions for Protein: P05367

Saa2, Serum amyloid A-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa2P05367 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Saa2P05367 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Saa2P05367 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Saa2P05367 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Saa2P05367 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Saa2P05367 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Saa2P05367 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Saa2P05367 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Saa2P05367 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Saa2P05367 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Saa2P05367 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Saa2P05367 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Saa2P05367 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Saa2P05367 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Saa2P05367 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Saa2P05367 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Saa2P05367 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Saa2P05367 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Saa2P05367 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Saa2P05367 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Saa2P05367 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Saa2P05367 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Saa2P05367 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Saa2P05367 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Saa2P05367 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Saa2P05367 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Saa2P05367 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Saa2P05367 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Saa2P05367 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Saa2P05367 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Saa2P05367 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Saa2P05367 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Saa2P05367 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Saa2P05367 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Saa2P05367 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Saa2P05367 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Saa2P05367 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Saa2P05367 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Saa2P05367 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Saa2P05367 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Saa2P05367 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Saa2P05367 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Saa2P05367 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Saa2P05367 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Saa2P05367 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Saa2P05367 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Saa2P05367 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Saa2P05367 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Saa2P05367 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Saa2P05367 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Saa2P05367 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Saa2P05367 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Saa2P05367 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Saa2P05367 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Saa2P05367 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Saa2P05367 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Saa2P05367 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Saa2P05367 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Saa2P05367 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Saa2P05367 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Saa2P05367 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Saa2P05367 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Saa2P05367 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Saa2P05367 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Saa2P05367 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Saa2P05367 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Saa2P05367 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Saa2P05367 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Saa2P05367 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Saa2P05367 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Saa2P05367 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Saa2P05367 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Saa2P05367 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Saa2P05367 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Saa2P05367 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Saa2P05367 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Saa2P05367 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Saa2P05367 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Saa2P05367 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Saa2P05367 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Saa2P05367 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Saa2P05367 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Saa2P05367 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Saa2P05367 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Saa2P05367 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Saa2P05367 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Saa2P05367 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Saa2P05367 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Saa2P05367 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Saa2P05367 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Saa2P05367 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Saa2P05367 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Saa2P05367 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Saa2P05367 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Saa2P05367 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Saa2P05367 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Saa2P05367 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Saa2P05367 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Saa2P05367 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Saa2P05367 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms