Protein–RNA interactions for Protein: Q6V4S5

Sdk2, Protein sidekick-2, mousemouse

Predictions only

Length 2,176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdk2Q6V4S5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37,38■■■■□ 3,57
Sdk2Q6V4S5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34,74■■■■□ 3,15
Sdk2Q6V4S5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,03■■■■□ 3,04
Sdk2Q6V4S5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,58■■■□□ 2,81
Sdk2Q6V4S5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32,45■■■□□ 2,78
Sdk2Q6V4S5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31,91■■■□□ 2,7
Sdk2Q6V4S5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Sdk2Q6V4S5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Sdk2Q6V4S5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,38■■■□□ 2,61
Sdk2Q6V4S5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31,37■■■□□ 2,61
Sdk2Q6V4S5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,29■■■□□ 2,6
Sdk2Q6V4S5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,07■■■□□ 2,57
Sdk2Q6V4S5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Sdk2Q6V4S5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,45■■■□□ 2,46
Sdk2Q6V4S5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,26■■■□□ 2,43
Sdk2Q6V4S5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Sdk2Q6V4S5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30,15■■■□□ 2,42
Sdk2Q6V4S5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,08■■■□□ 2,41
Sdk2Q6V4S5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Sdk2Q6V4S5 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Sdk2Q6V4S5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29,85■■■□□ 2,37
Sdk2Q6V4S5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Sdk2Q6V4S5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29,79■■■□□ 2,36
Sdk2Q6V4S5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Sdk2Q6V4S5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Sdk2Q6V4S5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Sdk2Q6V4S5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29,59■■■□□ 2,33
Sdk2Q6V4S5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Sdk2Q6V4S5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,57■■■□□ 2,32
Sdk2Q6V4S5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Sdk2Q6V4S5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Sdk2Q6V4S5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Sdk2Q6V4S5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,26■■■□□ 2,28
Sdk2Q6V4S5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Sdk2Q6V4S5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
Sdk2Q6V4S5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Sdk2Q6V4S5 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,95■■■□□ 2,22
Sdk2Q6V4S5 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Sdk2Q6V4S5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28,76■■■□□ 2,2
Sdk2Q6V4S5 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,67■■■□□ 2,18
Sdk2Q6V4S5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28,66■■■□□ 2,18
Sdk2Q6V4S5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC28,6■■■□□ 2,17
Sdk2Q6V4S5 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28,6■■■□□ 2,17
Sdk2Q6V4S5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Sdk2Q6V4S5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28,47■■■□□ 2,15
Sdk2Q6V4S5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
Sdk2Q6V4S5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28,37■■■□□ 2,13
Sdk2Q6V4S5 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28,33■■■□□ 2,12
Sdk2Q6V4S5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Sdk2Q6V4S5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Sdk2Q6V4S5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28,09■■■□□ 2,09
Sdk2Q6V4S5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Sdk2Q6V4S5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Sdk2Q6V4S5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27,96■■■□□ 2,07
Sdk2Q6V4S5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Sdk2Q6V4S5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,96■■■□□ 2,07
Sdk2Q6V4S5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Sdk2Q6V4S5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27,95■■■□□ 2,06
Sdk2Q6V4S5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27,93■■■□□ 2,06
Sdk2Q6V4S5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Sdk2Q6V4S5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27,92■■■□□ 2,06
Sdk2Q6V4S5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Sdk2Q6V4S5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Sdk2Q6V4S5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Sdk2Q6V4S5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,84■■■□□ 2,05
Sdk2Q6V4S5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Sdk2Q6V4S5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27,8■■■□□ 2,04
Sdk2Q6V4S5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27,76■■■□□ 2,03
Sdk2Q6V4S5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Sdk2Q6V4S5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Sdk2Q6V4S5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Sdk2Q6V4S5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,65■■■□□ 2,02
Sdk2Q6V4S5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Sdk2Q6V4S5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Sdk2Q6V4S5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Sdk2Q6V4S5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Sdk2Q6V4S5 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Sdk2Q6V4S5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Sdk2Q6V4S5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,98
Sdk2Q6V4S5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Sdk2Q6V4S5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27,42■■□□□ 1,98
Sdk2Q6V4S5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,41■■□□□ 1,98
Sdk2Q6V4S5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,37■■□□□ 1,97
Sdk2Q6V4S5 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Sdk2Q6V4S5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Sdk2Q6V4S5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,25■■□□□ 1,95
Sdk2Q6V4S5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Sdk2Q6V4S5 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Sdk2Q6V4S5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Sdk2Q6V4S5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Sdk2Q6V4S5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27,15■■□□□ 1,94
Sdk2Q6V4S5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Sdk2Q6V4S5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Sdk2Q6V4S5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27,08■■□□□ 1,93
Sdk2Q6V4S5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27,07■■□□□ 1,92
Sdk2Q6V4S5 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Sdk2Q6V4S5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27,06■■□□□ 1,92
Sdk2Q6V4S5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Sdk2Q6V4S5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Sdk2Q6V4S5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,6 ms