Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Vmn1r167G3UW71 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Vmn1r167G3UW71 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Vmn1r167G3UW71 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Vmn1r167G3UW71 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Vmn1r167G3UW71 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Vmn1r167G3UW71 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Vmn1r167G3UW71 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Vmn1r167G3UW71 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Vmn1r167G3UW71 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Vmn1r167G3UW71 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Vmn1r167G3UW71 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Vmn1r167G3UW71 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Vmn1r167G3UW71 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Vmn1r167G3UW71 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Vmn1r167G3UW71 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Vmn1r167G3UW71 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Vmn1r167G3UW71 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Vmn1r167G3UW71 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Vmn1r167G3UW71 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Vmn1r167G3UW71 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Vmn1r167G3UW71 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Vmn1r167G3UW71 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Vmn1r167G3UW71 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Vmn1r167G3UW71 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Vmn1r167G3UW71 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Vmn1r167G3UW71 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Vmn1r167G3UW71 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Vmn1r167G3UW71 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Vmn1r167G3UW71 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Vmn1r167G3UW71 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Vmn1r167G3UW71 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Vmn1r167G3UW71 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Vmn1r167G3UW71 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Vmn1r167G3UW71 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Vmn1r167G3UW71 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Vmn1r167G3UW71 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Vmn1r167G3UW71 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Vmn1r167G3UW71 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vmn1r167G3UW71 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vmn1r167G3UW71 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Vmn1r167G3UW71 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Vmn1r167G3UW71 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Vmn1r167G3UW71 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Vmn1r167G3UW71 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Vmn1r167G3UW71 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Vmn1r167G3UW71 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Vmn1r167G3UW71 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vmn1r167G3UW71 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vmn1r167G3UW71 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Vmn1r167G3UW71 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vmn1r167G3UW71 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vmn1r167G3UW71 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vmn1r167G3UW71 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Vmn1r167G3UW71 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vmn1r167G3UW71 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vmn1r167G3UW71 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vmn1r167G3UW71 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Vmn1r167G3UW71 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vmn1r167G3UW71 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Vmn1r167G3UW71 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vmn1r167G3UW71 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vmn1r167G3UW71 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vmn1r167G3UW71 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vmn1r167G3UW71 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vmn1r167G3UW71 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vmn1r167G3UW71 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Vmn1r167G3UW71 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vmn1r167G3UW71 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vmn1r167G3UW71 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vmn1r167G3UW71 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vmn1r167G3UW71 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Vmn1r167G3UW71 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Vmn1r167G3UW71 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vmn1r167G3UW71 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Vmn1r167G3UW71 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vmn1r167G3UW71 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vmn1r167G3UW71 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vmn1r167G3UW71 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vmn1r167G3UW71 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vmn1r167G3UW71 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vmn1r167G3UW71 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vmn1r167G3UW71 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vmn1r167G3UW71 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vmn1r167G3UW71 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Vmn1r167G3UW71 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Vmn1r167G3UW71 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Vmn1r167G3UW71 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Vmn1r167G3UW71 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vmn1r167G3UW71 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Vmn1r167G3UW71 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vmn1r167G3UW71 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Vmn1r167G3UW71 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vmn1r167G3UW71 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vmn1r167G3UW71 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vmn1r167G3UW71 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vmn1r167G3UW71 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Vmn1r167G3UW71 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vmn1r167G3UW71 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Vmn1r167G3UW71 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.2 ms