RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612839.1

CCL3L3-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 3 like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL3L3, Length 1,458 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L3-201ENST00000612839 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 PI3P19957 117 aa8.85□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 F2RP25116 425 aa8.85□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 GNB1P62873 340 aa8.85□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 FOXE3Q13461 319 aa8.85□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 BAK1Q16611 211 aa8.85□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF585BQ52M93 769 aa8.85□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 AKIRIN2Q53H80 203 aa8.85□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa8.85□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 TBC1D26Q86UD7 250 aa8.85□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 RNF152Q8N8N0 203 aa8.85□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 POC5Q8NA72 575 aa8.85□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 LFNGQ8NES3 379 aa8.85□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 GRPEL2Q8TAA5 225 aa8.85□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 CD300LFQ8TDQ1 290 aa8.85□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 ABHD5Q8WTS1 349 aa8.85□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 PLEKHA2Q9HB19 425 aa8.85□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa8.85□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 A0A1W2PN81 502 aa8.84□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 KBTBD11O94819 623 aa8.84□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 OR2A4O95047 310 aa8.84□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 S1PR2O95136 353 aa8.84□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 CNIH1O95406 144 aa8.84□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 HRASP01112 189 aa8.84□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 ELANEP08246 267 aa8.84□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 PGAM2P15259 253 aa8.84□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 CHRNA7P36544 502 aa8.84□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 TAS2R31P59538 309 aa8.84□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 POU2AF1Q16633 256 aa8.84□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 OR4A47Q6IF82 309 aa8.84□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 C18orf65Q6ZTR6 163 aa8.84□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 SSX9Q7RTT3 188 aa8.84□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa8.84□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 GDPD1Q8N9F7 314 aa8.84□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 OR51S1Q8NGJ8 323 aa8.84□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 OR13C8Q8NGS7 320 aa8.84□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 VSTM2AQ8TAG5 236 aa8.84□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa8.84□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 MARCH1Q8TCQ1 289 aa8.84□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 OR2A7Q96R45 310 aa8.84□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa8.84□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 KLK15Q9H2R5 256 aa8.84□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 ZFP57Q9NU63 452 aa8.84□□□□□ -0.99
CCL3L3-201ENST00000612839 A0A1B0GVG6 124 aa8.83□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 DISC1C4P0D8 188 aa8.83□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 MPPED1O15442 326 aa8.83□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 NQO2P16083 231 aa8.83□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 S100GP29377 79 aa8.83□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 PIGPP57054 158 aa8.83□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 RND3P61587 244 aa8.83□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 TNXAQ16473 311 aa8.83□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 C10orf55Q5SWW7 151 aa8.83□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 ASPHD1Q5U4P2 390 aa8.83□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa8.83□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 MMD2Q8IY49 270 aa8.83□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 MYOZ3Q8TDC0 251 aa8.83□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 CASTOR1Q8WTX7 329 aa8.83□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 R3HDM4Q96D70 268 aa8.83□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 PRRT1Q99946 306 aa8.83□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 AIFM2Q9BRQ8 373 aa8.83□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 SLC2A8Q9NY64 477 aa8.83□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 BET1LQ9NYM9 111 aa8.83□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 COMMD9Q9P000 198 aa8.83□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 CMYA5Q8N3K9 4069 aa8.83□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 IL7P13232 177 aa8.83□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 ECI1P42126 302 aa8.83□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 LPAR6P43657 344 aa8.83□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 TOMM5Q8N4H5 51 aa8.83□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 OR4F17Q8NGA8 305 aa8.83□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 OR5M8Q8NGP6 311 aa8.83□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 ZFAND1Q8TCF1 268 aa8.83□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 OR4F4Q96R69 305 aa8.83□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 MCUBQ9NWR8 336 aa8.83□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 TRAV3A0A0B4J244 114 aa8.82□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 MSGN1A6NI15 193 aa8.82□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 MARCH11A6NNE9 402 aa8.82□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 E7EUB6 86 aa8.82□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 ACTL6BO94805 426 aa8.82□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 IGKV1-39P01597 117 aa8.82□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 IGKV1D-39P04432 117 aa8.82□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 APELAP0DMC3 54 aa8.82□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 PF4V1P10720 104 aa8.82□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 RPA2P15927 270 aa8.82□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
CCL3L3-201ENST00000612839 RAB9AP51151 201 aa8.82□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms