RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513423.1

FGFR4-215, Transcript of fibroblast growth factor receptor 4, human

TSL 2

Gene FGFR4, Length 445 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGFR4-215	ENST00000513423	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	ZFP57	Q9NU63	452 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	COMMD9	Q9P000	198 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	NQO2	P16083	231 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	ECI1	P42126	302 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	GNB1	P62873	340 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	ZNF45	Q02386	682 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	TNXA	Q16473	311 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	OR4A47	Q6IF82	309 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	SSX9	Q7RTT3	188 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	CADM3	Q8N126	398 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	OR4A5	Q8NH83	315 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	KLK15	Q9H2R5	256 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	BET1L	Q9NYM9	111 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	GPR132	Q9UNW8	380 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423		A0A1W2PRX2	142 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	MSGN1	A6NI15	193 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	UPK2	O00526	184 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	AP3S2	P59780	193 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	ECSCR	Q19T08	205 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	ASPHD1	Q5U4P2	390 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	R3HDM4	Q96D70	268 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	MCUB	Q9NWR8	336 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	TRAV3	A0A0B4J244	114 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423		A0A1W2PN81	502 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	IGKV1-39	P01597	117 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	IGKV1D-39	P04432	117 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	MAS1L	P35410	378 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	CHRNA7	P36544	502 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	RAB9A	P51151	201 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	TREML4	Q6UXN2	200 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	DMBX1	Q8NFW5	382 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	TMEM68	Q96MH6	324 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	TP53RK	Q96S44	253 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	TMEM140	Q9NV12	185 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	COPZ2	Q9P299	210 aa		10.61	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	TNC	P24821	2201 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423		A0A1B0GW64	132 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	MARCH11	A6NNE9	402 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423		E7EUB6	86 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423		H0Y980	276 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	ACTL6B	O94805	426 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	KRAS	P01116	189 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	FGF2	P09038	288 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	PF4V1	P10720	104 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	RPA2	P15927	270 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	HLA-G	P17693	338 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	G6PC	P35575	357 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	ERVK-16	P61578	105 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	OR5T1	Q8NG75	326 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	OR4F4	Q96R69	305 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	VSIG4	Q9Y279	399 aa		10.6	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	ANK2	Q01484	3957 aa		10.59	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	CGB1	A6NKQ9	187 aa		10.59	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	BRI3	O95415	125 aa		10.59	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	SERPINE2	P07093	398 aa		10.59	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	IL7	P13232	177 aa		10.59	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	MYOD1	P15172	320 aa		10.59	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	UCP1	P25874	307 aa		10.59	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	SLC6A1	P30531	599 aa		10.59	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	SP6	Q3SY56	376 aa		10.59	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	TRIQK	Q629K1	86 aa		10.59	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	TMEM65	Q6PI78	240 aa		10.59	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	ZNF695	Q8IW36	515 aa		10.59	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		10.59	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	TMEM230	Q96A57	120 aa		10.59	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	SEC22A	Q96IW7	307 aa		10.59	□□□□□ -0.71
FGFR4-215	ENST00000513423	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		10.59	□□□□□ -0.71

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