RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 HARBI1Q96MB7 349 aa8.13□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 OVOL2Q9BRP0 275 aa8.13□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 CCDC32Q9BV29 185 aa8.13□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 SRRQ9GZT4 340 aa8.13□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 C12orf4Q9NQ89 552 aa8.13□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 COA4Q9NYJ1 87 aa8.13□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 ZNF221Q9UK13 617 aa8.13□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 S4R3C0 116 aa8.13□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 A0A0B4J203 849 aa8.12□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 HMX3A6NHT5 357 aa8.12□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 C2orf70A6NJV1 201 aa8.12□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 TEX22C9J3V5 150 aa8.12□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 OR2J3O76001 311 aa8.12□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 OR2A4O95047 310 aa8.12□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 IGHV3-23P01764 117 aa8.12□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 APOA2P02652 100 aa8.12□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 IFNA6P05013 189 aa8.12□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 FCGR3AP08637 254 aa8.12□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 OR9G9P0C7N8 305 aa8.12□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP8.12□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 KIR2DS2P43631 304 aa8.12□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 LGALS7P47929 136 aa8.12□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 RGS21Q2M5E4 152 aa8.12□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 RPEL1Q2QD12 228 aa8.12□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 SPANXN2Q5MJ10 180 aa8.12□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 LCN12Q6JVE5 192 aa8.12□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 SNX29P2Q8IUI4 249 aa8.12□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 ACOT12Q8WYK0 555 aa8.12□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.12□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 USMG5Q96IX5 58 aa8.12□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 SRD5A3Q9H8P0 318 aa8.12□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa8.12□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 TMEM213A2RRL7 107 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 CGB1A6NKQ9 187 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 OR11H12B2RN74 326 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 RAB27BO00194 218 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 MFNGO00587 321 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 BET1O15155 118 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 SHOXO15266 292 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 NDUFB8O95169 186 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 OR2C1O95371 312 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 CRYZL1O95825 349 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 FOLR2P14207 255 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 AADACP22760 399 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 CALRP27797 417 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 OR10A3P58181 314 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 UBE2KP61086 200 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 TNXAQ16473 311 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 GTSCR1Q86UQ5 136 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 TEX45Q8NA69 505 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 OR4A4PQ8NGN8 299 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 SNAPC3Q92966 411 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 FAM3DQ96BQ1 224 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 CCDC140Q96MF4 163 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 TMEM68Q96MH6 324 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 FANCD2OSQ96PS1 177 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 GPHA2Q96T91 129 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 TMEM127O75204 238 aa8.1□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 ARL6IP5O75915 188 aa8.1□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 JTBO76095 146 aa8.1□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 GNB3P16520 340 aa8.1□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 HES5Q5TA89 166 aa8.1□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 SFXN4Q6P4A7 337 aa8.1□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 TMEM61Q8N0U2 210 aa8.1□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 TTC9CQ8N5M4 171 aa8.1□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 OR2K2Q8NGT1 345 aa8.1□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 ZNF414Q96IQ9 312 aa8.1□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 MLXQ9UH92 298 aa8.1□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa8.09□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 SMIM30A4D0T7 59 aa8.09□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 NOTOA8MTQ0 251 aa8.09□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 TPPPO94811 219 aa8.09□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 HLA-DQB1P01920 261 aa8.09□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 IGKV1-13P0DP09 117 aa8.09□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 MYL9P24844 172 aa8.09□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 ATP5G2Q06055 141 aa8.09□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 RAB11BQ15907 218 aa8.09□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 C15orf32Q32M92 178 aa8.09□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 OR2B11Q5JQS5 317 aa8.09□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 MZT2AQ6P582 158 aa8.09□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa8.09□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 GDPD1Q8N9F7 314 aa8.09□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 THRSPQ92748 146 aa8.09□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 PHB2Q99623 299 aa8.09□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 MGAT4AQ9UM21 535 aa8.09□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 FABP12A6NFH5 140 aa8.08□□□□□ -1.12
NISCH-206ENST00000474188 RGS5O15539 181 aa8.08□□□□□ -1.12
NISCH-206ENST00000474188 HPGDSO60760 199 aa8.08□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57 ms