RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 PSMB11A5LHX3 300 aa19.01■□□□□ 0.63
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PTPRM-201ENST00000332175 GCSAMLQ5JQS6 135 aa19.01■□□□□ 0.63
PTPRM-201ENST00000332175 FAM159AQ6UWV7 190 aa19.01■□□□□ 0.63
PTPRM-201ENST00000332175 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa19.01■□□□□ 0.63
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PTPRM-201ENST00000332175 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
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PTPRM-201ENST00000332175 GPR183P32249 361 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 OR13A1Q8NGR1 328 aa18.94■□□□□ 0.62
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PTPRM-201ENST00000332175 M0R381 172 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 CENPWQ5EE01 88 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
PTPRM-201ENST00000332175 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
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