RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549308.5

PTPRR-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-209ENST00000549308 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
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PTPRR-209ENST00000549308 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP9.77□□□□□ -0.85
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PTPRR-209ENST00000549308 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 DYNAPQ8N1N2 210 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 VSTM2AQ8TAG5 236 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 C17orf50Q8WW18 174 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 CFHR4Q92496 578 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 MALSU1Q96EH3 234 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRR-209ENST00000549308 AQP10Q96PS8 301 aa9.73□□□□□ -0.85
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