RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027127.13

Sf3b1-201, Transcript of Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sf3b1, Length 6,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pip5k1aP70182 546 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rasl12Q08AT1 266 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tmem71Q149F5 287 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tmem18Q3TUD9 140 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Plk3Q60806 631 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tmem106cQ80VP8 260 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr483Q8VG05 315 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr979Q8VH10 311 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rnaseh2cQ9CQ18 166 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mien1Q9CQ86 115 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tmem50bQ9D1X9 158 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pi4kaE9Q3L2 2105 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm20219A0A1B0GRQ3 87 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr1490A0A1L1SVH0 321 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Nkx6-2D3Z4R4 277 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Zfp229E9PWT2 705 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Fgf12P61329 243 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr1340Q3KPC7 315 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Dll1Q61483 722 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 4922502D21RikQ8C634 189 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Zfp87Q8K2A4 540 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr469Q8VF66 314 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr1170Q8VFG1 316 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Wdr13Q91V09 485 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 FaimQ9WUD8 179 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr1158A2BHP7 313 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr231E9Q0M4 307 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Npffr1E9Q468 432 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 DffbO54788 344 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 GrprP21729 384 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Fam160a2Q3U2I3 975 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Nkain2Q4PNJ2 208 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm21943Q5FWD5 227 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr504Q7TRU7 318 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Klk14Q8CGR5 250 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rpp14Q9CQH8 122 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr914E9PW59 316 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Zfp36l2P23949 484 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pax9P47242 342 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Dnase2P56542 353 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cd59bP58019 129 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Vmn1r181Q0P547 304 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm11110Q3U4K9 109 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Vmn1r66Q8K4I0 310 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rab32Q9CZE3 223 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 4933407L21RikQ9D476 131 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Vmn1r180B9EK86 305 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cd200O54901 278 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ppp1cbP62141 327 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Pate2Q3UW31 111 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rasl10bQ5SSG5 203 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr1396Q7TQS8 315 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Mrps30Q9D0G0 442 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rep15Q9D7T1 230 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Znf319Q9ERR8 581 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr1264Q9R0K2 308 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cldn15Q9Z0S5 227 aa7.35□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Heatr5bQ8C547 2070 aa7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr685A0A1L1SVG7 331 aa7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Zdhhc22A0PK84 263 aa7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Zfp944E9PUS4 492 aa7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Slc46a1Q6PEM8 459 aa7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr1031Q7TR87 336 aa7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gpr84Q8CIM5 396 aa7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 TprkbQ8QZZ7 175 aa7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Defb8Q91V82 60 aa7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Vgll1Q99NC0 307 aa7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 IcaQ9DBD0 700 aa7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Sema7aQ9QUR8 664 aa7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cacna1bO55017 2327 aa7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Kcnj3P63250 501 aa7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Csrp1P97315 193 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Ctf1Q60753 203 aa7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cd55bQ61476 407 aa7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 ClmQ7TSN2 230 aa7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Dtx3Q80V91 347 aa7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr661Q99NH4 319 aa7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 AplfQ9D842 499 aa7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Olfr157Q9QZ20 318 aa7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tcrg-V1P06325 135 aa7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gabra6P16305 453 aa7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Hes1P35428 282 aa7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Dpagt1P42867 410 aa7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Col9a1Q05722 921 aa7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Taar9Q5QD04 348 aa7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gal3st2Q6XQH0 394 aa7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Fam117aQ7TNF9 451 aa7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Cdc42ep2Q8JZX9 214 aa7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 IdnkQ8R0J8 184 aa7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Rarres2Q9DD06 162 aa7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm29049A0A087WSM5 227 aa7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Tarm1B6A8R8 288 aa7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Lrp3E9Q1T6 790 aa7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm21118J3QPK8 227 aa7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Slc38a11Q3USY0 453 aa7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm20909Q5FWB5 227 aa7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm20852Q5M8R5 227 aa7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Npy4rQ61041 375 aa7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm20917Q62457 227 aa7.34□□□□□ -1.23
Sf3b1-201ENSMUST00000027127 Gm20809Q62458 227 aa7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 40.7 ms