Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L2

Pi4ka, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pi4kaE9Q3L2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39,83■■■■□ 3,97
Pi4kaE9Q3L2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37,08■■■■□ 3,53
Pi4kaE9Q3L2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,35■■■■□ 3,41
Pi4kaE9Q3L2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34,79■■■■□ 3,16
Pi4kaE9Q3L2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34,35■■■■□ 3,09
Pi4kaE9Q3L2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33,76■■■■□ 3
Pi4kaE9Q3L2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,74■■■□□ 2,99
Pi4kaE9Q3L2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33,55■■■□□ 2,96
Pi4kaE9Q3L2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
Pi4kaE9Q3L2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,4■■■□□ 2,94
Pi4kaE9Q3L2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33,11■■■□□ 2,89
Pi4kaE9Q3L2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32,57■■■□□ 2,81
Pi4kaE9Q3L2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
Pi4kaE9Q3L2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32,17■■■□□ 2,74
Pi4kaE9Q3L2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32,12■■■□□ 2,73
Pi4kaE9Q3L2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
Pi4kaE9Q3L2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Pi4kaE9Q3L2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,95■■■□□ 2,71
Pi4kaE9Q3L2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,84■■■□□ 2,69
Pi4kaE9Q3L2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,78■■■□□ 2,68
Pi4kaE9Q3L2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31,72■■■□□ 2,67
Pi4kaE9Q3L2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31,62■■■□□ 2,65
Pi4kaE9Q3L2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Pi4kaE9Q3L2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31,55■■■□□ 2,64
Pi4kaE9Q3L2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Pi4kaE9Q3L2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,16■■■□□ 2,58
Pi4kaE9Q3L2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Pi4kaE9Q3L2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31,1■■■□□ 2,57
Pi4kaE9Q3L2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Pi4kaE9Q3L2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30,89■■■□□ 2,54
Pi4kaE9Q3L2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,89■■■□□ 2,54
Pi4kaE9Q3L2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Pi4kaE9Q3L2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Pi4kaE9Q3L2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30,68■■■□□ 2,5
Pi4kaE9Q3L2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Pi4kaE9Q3L2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,58■■■□□ 2,49
Pi4kaE9Q3L2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30,55■■■□□ 2,48
Pi4kaE9Q3L2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30,46■■■□□ 2,47
Pi4kaE9Q3L2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30,26■■■□□ 2,43
Pi4kaE9Q3L2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Pi4kaE9Q3L2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30,22■■■□□ 2,43
Pi4kaE9Q3L2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Pi4kaE9Q3L2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Pi4kaE9Q3L2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30,18■■■□□ 2,42
Pi4kaE9Q3L2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Pi4kaE9Q3L2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Pi4kaE9Q3L2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29,96■■■□□ 2,39
Pi4kaE9Q3L2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,91■■■□□ 2,38
Pi4kaE9Q3L2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Pi4kaE9Q3L2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,84■■■□□ 2,37
Pi4kaE9Q3L2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29,83■■■□□ 2,37
Pi4kaE9Q3L2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29,81■■■□□ 2,36
Pi4kaE9Q3L2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29,75■■■□□ 2,35
Pi4kaE9Q3L2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,75■■■□□ 2,35
Pi4kaE9Q3L2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29,74■■■□□ 2,35
Pi4kaE9Q3L2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29,73■■■□□ 2,35
Pi4kaE9Q3L2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Pi4kaE9Q3L2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Pi4kaE9Q3L2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Pi4kaE9Q3L2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,49■■■□□ 2,31
Pi4kaE9Q3L2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Pi4kaE9Q3L2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Pi4kaE9Q3L2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29,42■■■□□ 2,3
Pi4kaE9Q3L2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,4■■■□□ 2,3
Pi4kaE9Q3L2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29,38■■■□□ 2,29
Pi4kaE9Q3L2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Pi4kaE9Q3L2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29,34■■■□□ 2,29
Pi4kaE9Q3L2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Pi4kaE9Q3L2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Pi4kaE9Q3L2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Pi4kaE9Q3L2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Pi4kaE9Q3L2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Pi4kaE9Q3L2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29,1■■■□□ 2,25
Pi4kaE9Q3L2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Pi4kaE9Q3L2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Pi4kaE9Q3L2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Pi4kaE9Q3L2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
Pi4kaE9Q3L2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Pi4kaE9Q3L2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28,91■■■□□ 2,22
Pi4kaE9Q3L2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Pi4kaE9Q3L2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28,84■■■□□ 2,21
Pi4kaE9Q3L2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Pi4kaE9Q3L2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Pi4kaE9Q3L2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Pi4kaE9Q3L2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,67■■■□□ 2,18
Pi4kaE9Q3L2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Pi4kaE9Q3L2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28,67■■■□□ 2,18
Pi4kaE9Q3L2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Pi4kaE9Q3L2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28,64■■■□□ 2,17
Pi4kaE9Q3L2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28,57■■■□□ 2,16
Pi4kaE9Q3L2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Pi4kaE9Q3L2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Pi4kaE9Q3L2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Pi4kaE9Q3L2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Pi4kaE9Q3L2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Pi4kaE9Q3L2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Pi4kaE9Q3L2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28,52■■■□□ 2,16
Pi4kaE9Q3L2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Pi4kaE9Q3L2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Pi4kaE9Q3L2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28,44■■■□□ 2,14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24,5 ms