Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUR8

Sema7a, Semaphorin-7A, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema7aQ9QUR8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
Sema7aQ9QUR8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sema7aQ9QUR8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Sema7aQ9QUR8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sema7aQ9QUR8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sema7aQ9QUR8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Sema7aQ9QUR8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sema7aQ9QUR8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Sema7aQ9QUR8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sema7aQ9QUR8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Sema7aQ9QUR8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Sema7aQ9QUR8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sema7aQ9QUR8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Sema7aQ9QUR8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sema7aQ9QUR8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Sema7aQ9QUR8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sema7aQ9QUR8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sema7aQ9QUR8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sema7aQ9QUR8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sema7aQ9QUR8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Sema7aQ9QUR8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sema7aQ9QUR8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sema7aQ9QUR8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sema7aQ9QUR8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sema7aQ9QUR8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sema7aQ9QUR8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sema7aQ9QUR8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Sema7aQ9QUR8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sema7aQ9QUR8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sema7aQ9QUR8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sema7aQ9QUR8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sema7aQ9QUR8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sema7aQ9QUR8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sema7aQ9QUR8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sema7aQ9QUR8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sema7aQ9QUR8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sema7aQ9QUR8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sema7aQ9QUR8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sema7aQ9QUR8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sema7aQ9QUR8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Sema7aQ9QUR8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sema7aQ9QUR8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sema7aQ9QUR8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sema7aQ9QUR8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sema7aQ9QUR8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sema7aQ9QUR8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sema7aQ9QUR8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sema7aQ9QUR8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sema7aQ9QUR8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sema7aQ9QUR8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sema7aQ9QUR8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sema7aQ9QUR8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sema7aQ9QUR8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sema7aQ9QUR8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Sema7aQ9QUR8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sema7aQ9QUR8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sema7aQ9QUR8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sema7aQ9QUR8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sema7aQ9QUR8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sema7aQ9QUR8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Sema7aQ9QUR8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sema7aQ9QUR8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sema7aQ9QUR8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sema7aQ9QUR8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sema7aQ9QUR8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema7aQ9QUR8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema7aQ9QUR8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sema7aQ9QUR8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Sema7aQ9QUR8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sema7aQ9QUR8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sema7aQ9QUR8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sema7aQ9QUR8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Sema7aQ9QUR8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sema7aQ9QUR8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sema7aQ9QUR8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sema7aQ9QUR8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema7aQ9QUR8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sema7aQ9QUR8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sema7aQ9QUR8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sema7aQ9QUR8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sema7aQ9QUR8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sema7aQ9QUR8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sema7aQ9QUR8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sema7aQ9QUR8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sema7aQ9QUR8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sema7aQ9QUR8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sema7aQ9QUR8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sema7aQ9QUR8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema7aQ9QUR8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sema7aQ9QUR8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sema7aQ9QUR8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sema7aQ9QUR8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sema7aQ9QUR8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sema7aQ9QUR8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Sema7aQ9QUR8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Sema7aQ9QUR8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema7aQ9QUR8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema7aQ9QUR8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sema7aQ9QUR8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sema7aQ9QUR8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms