RNA–Protein interactions for RNA: YGL238W

CSE1, Transcript of Nuclear envelope protein that mediates the nuclear export of Srp1p, yeast

Gene CSE1, Length 2,883 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CSE1	YGL238W	PEX6	P33760	1030 aa		0.85	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	APL3	P38065	1025 aa		0.85	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	SLX1	P38324	304 aa		0.85	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	JHD1	P40034	492 aa		0.85	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	MAD1	P40957	749 aa		0.85	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	0.85	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	0.85	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	0.85	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	PCL8	Q08966	492 aa		0.85	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	SRD1	P09007	221 aa		0.84	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	YMR085W	P0CF18	432 aa		0.84	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		0.84	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	YLR464W	P0CX17	216 aa		0.84	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	TSR4	P25040	408 aa		0.84	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	ARE1	P25628	610 aa		0.84	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	CNE1	P27825	502 aa		0.84	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	0.84	□□□□□ -2.27	not detected
CSE1	YGL238W	YEL076C	P39971	216 aa		0.84	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	PIG2	P40187	538 aa		0.84	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	SNO3	P43544	222 aa		0.84	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	IES1	P43579	692 aa		0.84	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	SAP4	P53036	818 aa		0.84	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	HUL5	P53119	910 aa		0.84	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	STP4	Q07351	490 aa		0.84	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	SPO75	Q07798	868 aa		0.84	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	0.84	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		0.84	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
CSE1	YGL238W	ERR1	P0CX10	437 aa		0.84	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	ERR2	P0CX11	437 aa		0.84	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	HOG1	P32485	435 aa		0.84	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	ELF1	P36053	145 aa		0.84	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	CFD1	P40558	293 aa		0.84	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	YFL015C	P43578	164 aa		0.84	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	ALY2	P47029	1046 aa		0.84	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	ARA2	Q04212	335 aa		0.84	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	RTT103	Q05543	409 aa		0.84	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	HRD3	Q05787	833 aa		0.84	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	GAL4	P04386	881 aa		0.83	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	PHO2	P07269	559 aa		0.83	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	CDC26	P14724	124 aa		0.83	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	MRPL9	P31334	269 aa		0.83	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	PET127	P32606	800 aa		0.83	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	COS111	P38308	924 aa		0.83	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	YIL077C	P40508	320 aa		0.83	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	YGR125W	P53273	1036 aa		0.83	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	ATG33	Q06485	197 aa		0.83	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	BSP1	Q06604	576 aa		0.83	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	REV3	P14284	1504 aa		0.83	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	YPR089W	O13585	888 aa		0.83	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	IMG2	P25642	146 aa	Predicted RBP	0.83	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	MGM1	P32266	881 aa		0.83	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	YKU70	P32807	602 aa		0.83	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	SDS24	P38314	527 aa		0.83	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	DUN1	P39009	513 aa		0.83	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	FTR1	P40088	404 aa		0.83	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	ATG36	P46983	293 aa		0.83	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	FDC1	Q03034	503 aa		0.83	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	HLR1	Q04429	423 aa		0.83	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	BUD7	Q08754	746 aa		0.83	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	0.83	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	SWI6	P09959	803 aa		0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	HMG1	P12683	1054 aa		0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	VPS8	P39702	1274 aa		0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	UBP7	P40453	1071 aa		0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	OPT1	P40897	799 aa		0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	YJL049W	P47048	450 aa		0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	COQ6	P53318	479 aa		0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	TIM50	Q02776	476 aa		0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	NHX1	Q04121	633 aa		0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	TLG2	Q08144	397 aa		0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	NTE1	Q04958	1679 aa		0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	SSK2	P53599	1579 aa		0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	VBA3	P25594	458 aa		0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	ATO2	P32907	282 aa		0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	HSL7	P38274	827 aa		0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	APD1	P38281	316 aa		0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	YHR202W	P38887	602 aa		0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	YIP4	P53093	235 aa		0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	RPN4	Q03465	531 aa		0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	MRPL1	Q04599	285 aa		0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	YLR407W	Q06070	228 aa		0.82	□□□□□ -2.28
CSE1	YGL238W	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28

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