RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567949.5

CTU2-210, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTU2, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-210ENST00000567949 WDR19Q8NEZ3 1342 aa24.21■■□□□ 1.47
CTU2-210ENST00000567949 APOBRQ0VD83 1088 aa24.2■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 LCORLQ8N3X6 602 aa24.2■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 CHAMP1Q96JM3 812 aa24.2■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24.2■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 GSG1L2A8MUP6 293 aa24.2■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 PDCP20941 246 aa24.2■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 KLHL40Q2TBA0 621 aa24.2■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 MTMR6Q9Y217 621 aa24.2■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 XDHP47989 1333 aa24.19■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 DTNBO60941 627 aa24.19■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 F13A1P00488 732 aa24.19■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 EVCP57679 992 aa24.19■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 SCRN1Q12765 414 aa24.19■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 TBC1D10CQ8IV04 446 aa24.19■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 FBXO41Q8TF61 875 aa24.19■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 NAPBQ9H115 298 aa24.19■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 CACNA1SQ13698 1873 aa24.19■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 PRC1O43663 620 aa24.18■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 TRDNQ13061 729 aa24.18■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 ADGRA1Q86SQ6 560 aa24.18■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 TXNRD3Q86VQ6 643 aa24.18■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 NLGN1Q8N2Q7 840 aa24.18■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 MIGA1Q8NAN2 632 aa24.18■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa24.18■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 MYH13Q9UKX3 1938 aa24.18■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 FLAD1Q8NFF5 587 aa24.18■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 NACAP1Q9BZK3 213 aa24.18■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 ANTXR2P58335 489 aa24.17■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa24.17■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa24.16■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 PRKAB2O43741 272 aa24.16■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 BBOX1O75936 387 aa24.16■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 SLC51AQ86UW1 340 aa24.16■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 CHMP4CQ96CF2 233 aa24.16■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 CRAMP1Q96RY5 1269 aa24.16■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa24.15■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 JAK2O60674 1132 aa24.14■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 GPSM2P81274 684 aa24.14■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
CTU2-210ENST00000567949 TIAM2Q8IVF5 1701 aa24.14■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 TDO2P48775 406 aa24.14■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 ZNF384Q8TF68 577 aa24.14■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa24.14■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 NRXN2Q9P2S2 1712 aa24.13■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 ATP2B4P23634 1241 aa24.12■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 BRIP1Q9BX63 1249 aa24.12■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 NEDD4P46934 1319 aa24.12■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 CCT2P78371 535 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 MECOMQ03112 1051 aa24.12■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 IGSF3O75054 1194 aa24.11■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 CTDNEP1O95476 244 aa24.11■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 CTDSPL2Q05D32 466 aa24.11■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 AKNAD1Q5T1N1 836 aa24.11■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 CYB5R4Q7L1T6 521 aa24.11■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 ZNF804AQ7Z570 1209 aa24.11■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 MAST2Q6P0Q8 1798 aa24.11■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 SALL1Q9NSC2 1324 aa24.1■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 B4E1Z4 1266 aa24.1■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 CDC37L1Q7L3B6 337 aa24.1■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 TMC4Q7Z404 712 aa24.1■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 TMEM87AQ8NBN3 555 aa24.1■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 GPT2Q8TD30 523 aa24.1■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 CNNM2Q9H8M5 875 aa24.1■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 PODXL2Q9NZ53 605 aa24.1■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 BRPF3Q9ULD4 1205 aa24.1■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa24.1■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa24.1■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 POTEAQ6S8J7 498 aa24.1■■□□□ 1.45
CTU2-210ENST00000567949 NKX2-3Q8TAU0 364 aa24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.3 ms