RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559257.5

USP3-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5

Gene USP3, Length 2,217 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-211ENST00000559257 CYP27B1O15528 508 aa9.62□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 DESP17661 470 aa9.62□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 CCT5P48643 541 aa9.62□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 INHBCP55103 352 aa9.62□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 ADCY1Q08828 1119 aa9.62□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 CCDC40Q4G0X9 1142 aa9.62□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 NUGGCQ68CJ6 796 aa9.62□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 ACSBG1Q96GR2 724 aa9.62□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 SPAG5Q96R06 1193 aa9.62□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 TSC22D3Q99576 134 aa9.62□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 FAM204AQ9H8W3 233 aa9.62□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 ITM2BQ9Y287 266 aa9.62□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 PZPP20742 1482 aa9.62□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 RALGAPBQ86X10 1494 aa9.62□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 A6NNZ2 444 aa9.62□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 PENKP01210 267 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 MCM2P49736 904 aa9.62□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 SCNN1BP51168 640 aa9.62□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 GSDMDP57764 484 aa9.62□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 ETF1P62495 437 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 TUBB8Q3ZCM7 444 aa9.62□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 TMC6Q7Z403 805 aa9.62□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 CEP57Q86XR8 500 aa9.62□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP9.62□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 CORO1BQ9BR76 489 aa9.62□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 GBP3Q9H0R5 595 aa9.62□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 ZWILCHQ9H900 591 aa9.62□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 ZSCAN12O43309 604 aa9.61□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 TXLNAP40222 546 aa9.61□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 PSMD7P51665 324 aa9.61□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 E2F5Q15329 346 aa9.61□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa9.61□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 CCDC144BQ3MJ40 725 aa9.61□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 CATIPQ7Z7H3 387 aa9.61□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa9.61□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa9.61□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa9.61□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 SWAP70Q9UH65 585 aa9.61□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 A6NHS1 94 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 TUBBP07437 444 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 NAT2P11245 290 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 ATP5JP18859 108 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP9.6□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 CUL4BQ13620 913 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 SAPCD2Q86UD0 394 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 VIPAS39Q9H9C1 493 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 GGA2Q9UJY4 613 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 RAB21Q9UL25 225 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 ADAMTS8Q9UP79 889 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 MGRN1O60291 552 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 MBD4O95243 580 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 MMEP08473 750 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 GNAT1P11488 350 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 HDAC4P56524 1084 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 NUCB1Q02818 461 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 CUL4AQ13619 759 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 TAF4BQ92750 862 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 GOLGA1Q92805 767 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 YIPF3Q9GZM5 350 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 EBF2Q9HAK2 575 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 QPCTLQ9NXS2 382 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 L1RE1Q9UN81 338 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 MSH6P52701 1360 aa9.6□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 CCDC69A6NI79 296 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 KIF4AO95239 1232 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 IDO1P14902 403 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 AMPHP49418 695 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 OLFML1Q6UWY5 402 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 SLF2Q8IX21 1173 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 SPIRE2Q8WWL2 714 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 PPP1R14BQ96C90 147 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 TRIM11Q96F44 468 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 CHAMP1Q96JM3 812 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 PRAM1Q96QH2 718 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 CARD6Q9BX69 1037 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 PPME1Q9Y570 386 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 ABLIM1O14639 778 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 KCNA2P16389 499 aa9.59□□□□□ -0.87
USP3-211ENST00000559257 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms