RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547541.1

TARBP2-208, Transcript of TARBP2, RISC loading complex RNA binding subunit, human

TSL 3

Gene TARBP2, Length 430 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARBP2-208	ENST00000547541	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	TMX3	Q96JJ7	454 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	12.01	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		12.01	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	FOXP2	O15409	715 aa		12	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	LDHC	P07864	332 aa		12	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	DDIT3	P35638	169 aa		12	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		12	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	12	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		12	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	12	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		12	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541		E7EWF7	191 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	MBD4	O95243	580 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	TGFB2	P61812	414 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	MECOM	Q03112	1051 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	SLF2	Q8IX21	1173 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	11.99	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	MTFR1L	Q9H019	292 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	LTBP1	Q14766	1721 aa		11.99	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	APP	P05067	770 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	POLD1	P28340	1107 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	AK2	P54819	239 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	PODN	Q7Z5L7	613 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	VPS33B	Q9H267	617 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	ARMT1	Q9H993	441 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	NT5C2	P49902	561 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	PPP4C	P60510	307 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	LCORL	Q8N3X6	602 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	TTLL6	Q8N841	843 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	NCOA7	Q8NI08	942 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	NAPB	Q9H115	298 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	BAG3	O95817	575 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	PRDX5	P30044	214 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	CHRNA5	P30532	468 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	NUCB2	P80303	420 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	TRDN	Q13061	729 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	SOGA3	Q5TF21	947 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	ZNF384	Q8TF68	577 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	MTA3	Q9BTC8	594 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TARBP2-208	ENST00000547541	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TARBP2-208	ENST00000547541		G3V3G9	751 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TARBP2-208	ENST00000547541	MCM5	P33992	734 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TARBP2-208	ENST00000547541	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TARBP2-208	ENST00000547541	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TARBP2-208	ENST00000547541	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TARBP2-208	ENST00000547541	MRI	Q9BWK5	157 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TARBP2-208	ENST00000547541	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TARBP2-208	ENST00000547541	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TARBP2-208	ENST00000547541	CACNA1S	Q13698	1873 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TARBP2-208	ENST00000547541	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
TARBP2-208	ENST00000547541	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TARBP2-208	ENST00000547541	RIMBP2	O15034	1052 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TARBP2-208	ENST00000547541	CPA1	P15085	419 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TARBP2-208	ENST00000547541	PLCG2	P16885	1265 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TARBP2-208	ENST00000547541	TDO2	P48775	406 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TARBP2-208	ENST00000547541	EVC	P57679	992 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TARBP2-208	ENST00000547541	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TARBP2-208	ENST00000547541	SBK1	Q52WX2	424 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TARBP2-208	ENST00000547541	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TARBP2-208	ENST00000547541	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		11.94	□□□□□ -0.5
TARBP2-208	ENST00000547541	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	11.94	□□□□□ -0.5
TARBP2-208	ENST00000547541	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms