RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522469.5

RBM22-208, Transcript of RNA binding motif protein 22, human

TSL 2

Gene RBM22, Length 989 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM22-208	ENST00000522469	RNF112	Q9ULX5	631 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	CUX2	O14529	1486 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM22-208	ENST00000522469	KCNA1	Q09470	495 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	ZFP64	Q9NPA5	681 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	ABCC8	Q09428	1581 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	IGLV1-40	P01703	118 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	ITPKA	P23677	461 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	MAPK1	P28482	360 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	TMC7	Q7Z402	723 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	ZNF576	Q9H609	170 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	7.32	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	GOLGA3	Q08378	1498 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	B3GALT4	O96024	378 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	CYP11A1	P05108	521 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	BMP3	P12645	472 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	CEP162	Q5TB80	1403 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	ABCB6	Q9NP58	842 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	TIAF1	O95411	115 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	EXOSC6	Q5RKV6	272 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	BEND4	Q6ZU67	534 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	NFIA	Q12857	509 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	POU4F3	Q15319	338 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	RNF43	Q68DV7	783 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	HMX2	A2RU54	273 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	TREH	O43280	583 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	DLGAP3	O95886	979 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	MAOB	P27338	520 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	GRM2	Q14416	872 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	CORO1B	Q9BR76	489 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM22-208	ENST00000522469	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM22-208	ENST00000522469	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
RBM22-208	ENST00000522469	AP3B2	Q13367	1082 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM22-208	ENST00000522469	DSC3	Q14574	896 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM22-208	ENST00000522469	NBPF11	Q86T75	865 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM22-208	ENST00000522469	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
RBM22-208	ENST00000522469	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
RBM22-208	ENST00000522469	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM22-208	ENST00000522469	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM22-208	ENST00000522469	HYAL3	O43820	417 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RBM22-208	ENST00000522469	ADH5	P11766	374 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RBM22-208	ENST00000522469	RXRB	P28702	533 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RBM22-208	ENST00000522469	PLCB3	Q01970	1234 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RBM22-208	ENST00000522469	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RBM22-208	ENST00000522469	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RBM22-208	ENST00000522469	SGO2	Q562F6	1265 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RBM22-208	ENST00000522469	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RBM22-208	ENST00000522469	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
RBM22-208	ENST00000522469	USP11	P51784	963 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RBM22-208	ENST00000522469	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	7.25	□□□□□ -1.25
RBM22-208	ENST00000522469	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RBM22-208	ENST00000522469	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RBM22-208	ENST00000522469	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
RBM22-208	ENST00000522469	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RBM22-208	ENST00000522469	KIF21B	O75037	1637 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RBM22-208	ENST00000522469	SOGA1	O94964	1423 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RBM22-208	ENST00000522469	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RBM22-208	ENST00000522469	COBL	O75128	1261 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RBM22-208	ENST00000522469	TGFB1	P01137	390 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RBM22-208	ENST00000522469	CTSB	P07858	339 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RBM22-208	ENST00000522469	DRD2	P14416	443 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RBM22-208	ENST00000522469	GRIK1	P39086	918 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RBM22-208	ENST00000522469	FCGRT	P55899	365 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RBM22-208	ENST00000522469	PI16	Q6UXB8	463 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RBM22-208	ENST00000522469	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RBM22-208	ENST00000522469	FBF1	Q8TES7	1133 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RBM22-208	ENST00000522469	ASB16	Q96NS5	453 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RBM22-208	ENST00000522469	BCO2	Q9BYV7	579 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RBM22-208	ENST00000522469	RAD18	Q9NS91	495 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RBM22-208	ENST00000522469	CD97	P48960	835 aa		7.23	□□□□□ -1.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms