RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506510.6

PDE4D-215, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4

Gene PDE4D, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-215ENST00000506510 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PDE4D-215ENST00000506510 SART1O43290 800 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 CYP11A1P05108 521 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 POU4F3Q15319 338 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 NUTM2GQ5VZR2 741 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 PPP4R2Q9NY27 417 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 AKAP2Q9Y2D5 859 aa8.46□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 MEGF11A6BM72 1044 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 LDHBP07195 334 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 UVSSAQ2YD98 709 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 CORO1BQ9BR76 489 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 OSBPL7Q9BZF2 842 aa8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 DHX15O43143 795 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 MYRFLQ96LU7 910 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 CYP4F12Q9HCS2 524 aa8.44□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 GAS2O43903 313 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 C3orf58Q8NDZ4 430 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 SUGCTQ9HAC7 445 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 SPG7Q9UQ90 795 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 RAXQ9Y2V3 346 aa8.43□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 TIAF1O95411 115 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 BMP3P12645 472 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 DRD2P14416 443 aa8.42□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 FSTP19883 344 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 GSTT1P30711 240 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 AP3B2Q13367 1082 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 PDE3AQ14432 1141 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 SGO2Q562F6 1265 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 NPAS4Q8IUM7 802 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 FAM20CQ8IXL6 584 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 KCNF1Q9H3M0 494 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 C12orf49Q9H741 205 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 RNF19AQ9NV58 838 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 TMEM39AQ9NV64 488 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 STOML1Q9UBI4 398 aa8.41□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 FBXO24O75426 580 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 ADH5P11766 374 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 PPP2R3AQ06190 1150 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 TPTE2Q6XPS3 522 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 C7orf69Q9H7B7 122 aa8.4□□□□□ -1.06
PDE4D-215ENST00000506510 HMX2A2RU54 273 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 USP17L7P0C7H9 530 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 CCDC27Q2M243 656 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 AKAP4Q5JQC9 854 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 TRIM42Q8IWZ5 723 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 RAD18Q9NS91 495 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 AP4E1Q9UPM8 1137 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 HIF3AQ9Y2N7 669 aa8.39□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 GIPC1O14908 333 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 GNA15P30679 374 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 COL19A1Q14993 1142 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 BEND4Q6ZU67 534 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 SULF2Q8IWU5 870 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 STK35Q8TDR2 534 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 FAM8A1Q9UBU6 413 aa8.38□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 LIG1P18858 919 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 RXRBP28702 533 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 WDR18Q9BV38 432 aa8.37□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 AOC2O75106 756 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 USP11P51784 963 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 CDPF1Q6NVV7 123 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 PDZD3Q86UT5 571 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 CLEC10AQ8IUN9 316 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 FAM83CQ9BQN1 747 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 PPM1HQ9ULR3 514 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 ACTL7BQ9Y614 415 aa8.36□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 ENC1O14682 589 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 PAGE1O75459 146 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 IGLV1-40P01703 118 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 NFIAQ12857 509 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 DYMQ7RTS9 669 aa8.35□□□□□ -1.07
PDE4D-215ENST00000506510 FBLIM1Q8WUP2 373 aa8.35□□□□□ -1.07
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