RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496565.5

LPIN3-204, Transcript of lipin 3, human

TSL 3

Gene LPIN3, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LPIN3-204	ENST00000496565	TTLL6	Q8N841	843 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	NEK1	Q96PY6	1258 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	LTBP1	Q14766	1721 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		11.18	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	C6orf229	H3BNL8	230 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	ZNF213	O14771	459 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	CUL4A	Q13619	759 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	11.17	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	TTC14	Q96N46	770 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	PSMD1	Q99460	953 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	RAI14	Q9P0K7	980 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	ABCF2	Q9UG63	623 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		11.17	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565		M0R2C6	588 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	SNAP23	O00161	211 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	FGA	P02671	866 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	CYP21A2	P08686	494 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	CYP7A1	P22680	504 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	TRDN	Q13061	729 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	PI16	Q6UXB8	463 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	RASEF	Q8IZ41	740 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	RGS22	Q8NE09	1264 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	POLL	Q9UGP5	575 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	PALD1	Q9ULE6	856 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	COL4A1	P02462	1669 aa		11.16	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	RPS6KB1	P23443	525 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	NUCB2	P80303	420 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	CCDC93	Q567U6	631 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	MSL1	Q68DK7	614 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	NCOA7	Q8NI08	942 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	NAPB	Q9H115	298 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		11.15	□□□□□ -0.62
LPIN3-204	ENST00000496565		G3V3G9	751 aa		11.14	□□□□□ -0.63
LPIN3-204	ENST00000496565	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
LPIN3-204	ENST00000496565	EVC	P57679	992 aa		11.14	□□□□□ -0.63
LPIN3-204	ENST00000496565	SBK1	Q52WX2	424 aa		11.14	□□□□□ -0.63
LPIN3-204	ENST00000496565	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		11.14	□□□□□ -0.63
LPIN3-204	ENST00000496565	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		11.14	□□□□□ -0.63
LPIN3-204	ENST00000496565	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		11.14	□□□□□ -0.63
LPIN3-204	ENST00000496565	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
LPIN3-204	ENST00000496565	TMTC2	Q8N394	836 aa		11.14	□□□□□ -0.63
LPIN3-204	ENST00000496565	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
LPIN3-204	ENST00000496565	KRT23	Q9C075	422 aa		11.14	□□□□□ -0.63
LPIN3-204	ENST00000496565	PIM2	Q9P1W9	311 aa		11.14	□□□□□ -0.63
LPIN3-204	ENST00000496565	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		11.13	□□□□□ -0.63
LPIN3-204	ENST00000496565	CACNA1S	Q13698	1873 aa		11.13	□□□□□ -0.63
LPIN3-204	ENST00000496565	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
LPIN3-204	ENST00000496565	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		11.13	□□□□□ -0.63
LPIN3-204	ENST00000496565		E7EWF7	191 aa		11.13	□□□□□ -0.63
LPIN3-204	ENST00000496565	MBD4	O95243	580 aa		11.13	□□□□□ -0.63
LPIN3-204	ENST00000496565	APP	P05067	770 aa		11.13	□□□□□ -0.63
LPIN3-204	ENST00000496565	PTMS	P20962	102 aa		11.13	□□□□□ -0.63
LPIN3-204	ENST00000496565	MCM5	P33992	734 aa		11.13	□□□□□ -0.63
LPIN3-204	ENST00000496565	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
LPIN3-204	ENST00000496565	MECOM	Q03112	1051 aa		11.13	□□□□□ -0.63
LPIN3-204	ENST00000496565	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		11.13	□□□□□ -0.63
LPIN3-204	ENST00000496565	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		11.13	□□□□□ -0.63
LPIN3-204	ENST00000496565	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		11.13	□□□□□ -0.63
LPIN3-204	ENST00000496565	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
LPIN3-204	ENST00000496565	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		11.13	□□□□□ -0.63
LPIN3-204	ENST00000496565	TMX3	Q96JJ7	454 aa		11.13	□□□□□ -0.63
LPIN3-204	ENST00000496565	TMEM87B	Q96K49	555 aa		11.13	□□□□□ -0.63
LPIN3-204	ENST00000496565	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		11.13	□□□□□ -0.63
LPIN3-204	ENST00000496565	SNED1	Q8TER0	1413 aa		11.12	□□□□□ -0.63
LPIN3-204	ENST00000496565	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		11.12	□□□□□ -0.63
LPIN3-204	ENST00000496565	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
LPIN3-204	ENST00000496565	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
LPIN3-204	ENST00000496565	FGR	P09769	529 aa		11.12	□□□□□ -0.63
LPIN3-204	ENST00000496565	DDIT3	P35638	169 aa		11.12	□□□□□ -0.63
LPIN3-204	ENST00000496565	RCAN1	P53805	252 aa		11.12	□□□□□ -0.63
LPIN3-204	ENST00000496565	PPP2R5B	Q15173	497 aa		11.12	□□□□□ -0.63
LPIN3-204	ENST00000496565	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		11.12	□□□□□ -0.63
LPIN3-204	ENST00000496565	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		11.12	□□□□□ -0.63

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