RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487577.5

TYMP-208, Transcript of thymidine phosphorylase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TYMP, Length 1,751 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMP-208ENST00000487577 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP29.33■■■□□ 2.29
TYMP-208ENST00000487577 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 H0YIN7 160 aa29.32■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 C6orf229H3BNL8 230 aa29.32■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 GNAT2P19087 354 aa29.32■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP29.32■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 MIGA1Q8NAN2 632 aa29.32■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 POLLQ9UGP5 575 aa29.32■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 LCORLQ8N3X6 602 aa29.31■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 CACNA1SQ13698 1873 aa29.31■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 CCDC125Q86Z20 511 aa29.31■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 WDR66Q8TBY9 1149 aa29.31■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 JAG2Q9Y219 1238 aa29.31■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 LAMA4Q16363 1823 aa29.3■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa29.3■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 ADGRA1Q86SQ6 560 aa29.29■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa29.29■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 LTBP1Q14766 1721 aa29.29■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 RAB3GAP1Q15042 981 aa29.29■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 ALX1Q15699 326 aa29.29■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 STYK1Q6J9G0 422 aa29.29■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 IFNL3Q8IZI9 196 aa29.29■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 NACAP1Q9BZK3 213 aa29.29■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 CD209Q9NNX6 404 aa29.29■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 ZMYM6O95789 1325 aa29.28■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 SALL1Q9NSC2 1324 aa29.28■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 NUCB2P80303 420 aa29.28■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 MECOMQ03112 1051 aa29.28■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 MPNDQ8N594 471 aa29.28■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 NAPBQ9H115 298 aa29.28■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 LARGE1O95461 756 aa29.27■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 PRDX5P30044 214 aa29.27■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 FGD1P98174 961 aa29.27■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 Q6ZUG5 572 aa29.27■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 TPCN1Q9ULQ1 816 aa29.27■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa29.27■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.28
TYMP-208ENST00000487577 GSG1L2A8MUP6 293 aa29.26■■■□□ 2.27
TYMP-208ENST00000487577 IL1R1P14778 569 aa29.26■■■□□ 2.27
TYMP-208ENST00000487577 ME3Q16798 604 aa29.26■■■□□ 2.27
TYMP-208ENST00000487577 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
TYMP-208ENST00000487577 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
TYMP-208ENST00000487577 MAST2Q6P0Q8 1798 aa29.26■■■□□ 2.27
TYMP-208ENST00000487577 PRKAB2O43741 272 aa29.25■■■□□ 2.27
TYMP-208ENST00000487577 IGSF3O75054 1194 aa29.25■■■□□ 2.27
TYMP-208ENST00000487577 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
TYMP-208ENST00000487577 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
TYMP-208ENST00000487577 ZNF384Q8TF68 577 aa29.25■■■□□ 2.27
TYMP-208ENST00000487577 TDO2P48775 406 aa29.24■■■□□ 2.27
TYMP-208ENST00000487577 OLFM4Q6UX06 510 aa29.24■■■□□ 2.27
TYMP-208ENST00000487577 NCOA7Q8NI08 942 aa29.24■■■□□ 2.27
TYMP-208ENST00000487577 SLC16A10Q8TF71 515 aa29.24■■■□□ 2.27
TYMP-208ENST00000487577 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
TYMP-208ENST00000487577 LDHBP07195 334 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
TYMP-208ENST00000487577 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
TYMP-208ENST00000487577 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
TYMP-208ENST00000487577 CCDC83Q8IWF9 413 aa29.24■■■□□ 2.27
TYMP-208ENST00000487577 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
TYMP-208ENST00000487577 CHRNA5P30532 468 aa29.23■■■□□ 2.27
TYMP-208ENST00000487577 CNKSR1Q969H4 720 aa29.23■■■□□ 2.27
TYMP-208ENST00000487577 LRRC2Q9BYS8 371 aa29.23■■■□□ 2.27
TYMP-208ENST00000487577 RIMBP2O15034 1052 aa29.22■■■□□ 2.27
TYMP-208ENST00000487577 TRDNQ13061 729 aa29.22■■■□□ 2.27
TYMP-208ENST00000487577 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
TYMP-208ENST00000487577 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
TYMP-208ENST00000487577 BRF1Q92994 677 aa29.21■■■□□ 2.27
TYMP-208ENST00000487577 NBPF3Q9H094 633 aa29.21■■■□□ 2.27
TYMP-208ENST00000487577 DUOX1Q9NRD9 1551 aa29.2■■■□□ 2.27
TYMP-208ENST00000487577 TBC1D10CQ8IV04 446 aa29.2■■■□□ 2.26
TYMP-208ENST00000487577 NECAB1Q8N987 351 aa29.2■■■□□ 2.26
TYMP-208ENST00000487577 COA1Q9GZY4 146 aa29.2■■■□□ 2.26
TYMP-208ENST00000487577 SMC3Q9UQE7 1217 aa29.2■■■□□ 2.26
TYMP-208ENST00000487577 MCM5P33992 734 aa29.19■■■□□ 2.26
TYMP-208ENST00000487577 CHST3Q7LGC8 479 aa29.19■■■□□ 2.26
TYMP-208ENST00000487577 SDR42E1Q8WUS8 393 aa29.19■■■□□ 2.26
TYMP-208ENST00000487577 GSTO1P78417 241 aa29.18■■■□□ 2.26
TYMP-208ENST00000487577 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
TYMP-208ENST00000487577 EYA3Q99504 573 aa29.18■■■□□ 2.26
TYMP-208ENST00000487577 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP29.18■■■□□ 2.26
TYMP-208ENST00000487577 PKP1Q13835 747 aa29.17■■■□□ 2.26
TYMP-208ENST00000487577 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa29.17■■■□□ 2.26
TYMP-208ENST00000487577 GBP4Q96PP9 640 aa29.17■■■□□ 2.26
TYMP-208ENST00000487577 AGXT2Q9BYV1 514 aa29.17■■■□□ 2.26
TYMP-208ENST00000487577 SLX4Q8IY92 1834 aa29.17■■■□□ 2.26
TYMP-208ENST00000487577 PRC1O43663 620 aa29.16■■■□□ 2.26
TYMP-208ENST00000487577 ST3GAL1Q11201 340 aa29.16■■■□□ 2.26
TYMP-208ENST00000487577 STK3Q13188 491 aa29.16■■■□□ 2.26
TYMP-208ENST00000487577 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
TYMP-208ENST00000487577 C10orf71Q711Q0 1435 aa29.16■■■□□ 2.26
TYMP-208ENST00000487577 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa29.16■■■□□ 2.26
TYMP-208ENST00000487577 G3V3G9 751 aa29.15■■■□□ 2.26
TYMP-208ENST00000487577 CTDSPL2Q05D32 466 aa29.15■■■□□ 2.26
TYMP-208ENST00000487577 MFSD14BQ5SR56 506 aa29.15■■■□□ 2.26
TYMP-208ENST00000487577 DCAF8Q5TAQ9 597 aa29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms