RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP7.76□□□□□ -1.179e-54■■■■■ 28.8
RABGGTB-210ENST00000485459 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-210ENST00000485459 ASB16Q96NS5 453 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-210ENST00000485459 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa7.76□□□□□ -1.17
RABGGTB-210ENST00000485459 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGGTB-210ENST00000485459 DLGAP3O95886 979 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGGTB-210ENST00000485459 RXRBP28702 533 aa7.75□□□□□ -1.17
RABGGTB-210ENST00000485459 ATP2B2Q01814 1243 aa7.75□□□□□ -1.17
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RABGGTB-210ENST00000485459 USP11P51784 963 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-210ENST00000485459 BEND4Q6ZU67 534 aa7.74□□□□□ -1.17
RABGGTB-210ENST00000485459 TRIM42Q8IWZ5 723 aa7.74□□□□□ -1.17
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RABGGTB-210ENST00000485459 Q8N3U1 123 aa7.74□□□□□ -1.17
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RABGGTB-210ENST00000485459 HMX2A2RU54 273 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-210ENST00000485459 DRD2P14416 443 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-210ENST00000485459 PDE3AQ14432 1141 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-210ENST00000485459 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-210ENST00000485459 NXPE4Q6UWF7 544 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-210ENST00000485459 GLIS3Q8NEA6 775 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-210ENST00000485459 C7orf69Q9H7B7 122 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-210ENST00000485459 SUGCTQ9HAC7 445 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-210ENST00000485459 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-210ENST00000485459 AKAP2Q9Y2D5 859 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-210ENST00000485459 HIF3AQ9Y2N7 669 aa7.73□□□□□ -1.17
RABGGTB-210ENST00000485459 PPP2R3AQ06190 1150 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-210ENST00000485459 AP3B2Q13367 1082 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC51AQ86UW1 340 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-210ENST00000485459 CLEC10AQ8IUN9 316 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-210ENST00000485459 FBF1Q8TES7 1133 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-210ENST00000485459 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-210ENST00000485459 NRSN2Q9GZP1 204 aa7.72□□□□□ -1.17
RABGGTB-210ENST00000485459 IGLV1-40P01703 118 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 NFIAQ12857 509 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 SGO2Q562F6 1265 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 AKAP4Q5JQC9 854 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 ALG1LQ6GMV1 187 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 TIAF1O95411 115 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 ECEL1O95672 775 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 CTSBP07858 339 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 FAAP100Q0VG06 881 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM83CQ9BQN1 747 aa7.7□□□□□ -1.18
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RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM39AQ9NV64 488 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 AP4E1Q9UPM8 1137 aa7.7□□□□□ -1.18
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RABGGTB-210ENST00000485459 RNF43Q68DV7 783 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 DYMQ7RTS9 669 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 SETDB2Q96T68 719 aa7.69□□□□□ -1.18
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RABGGTB-210ENST00000485459 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 WWC3Q9ULE0 1092 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 RNF112Q9ULX5 631 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 SPG7Q9UQ90 795 aa7.69□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 LDHBP07195 334 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 P4HBP07237 508 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 GSTT1P30711 240 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 LRP8Q14114 963 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 NFKBIBQ15653 356 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 FBLIM1Q8WUP2 373 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 ZFP64Q9NPA5 681 aa7.68□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 RAB6AP20340 208 aa7.67□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 ARTNQ5T4W7 220 aa7.67□□□□□ -1.18
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RABGGTB-210ENST00000485459 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 NBPF11Q86T75 865 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 FBXL6Q8N531 539 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 GIMAP7Q8NHV1 300 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 KCNB2Q92953 911 aa7.66□□□□□ -1.18
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RABGGTB-210ENST00000485459 ANKRD33BA6NCL7 494 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 GIPC1O14908 333 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 TGFB1P01137 390 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 SLFN14P0C7P3 912 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 SSTR4P31391 388 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 XP32Q5T750 250 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 TPTE2Q6XPS3 522 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 SULF2Q8IWU5 870 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGGTB-210ENST00000485459 CBX8Q9HC52 389 aa7.65□□□□□ -1.18
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