RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 DHX15O43143 795 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 IRAK1P51617 712 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 UVSSAQ2YD98 709 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 FDX2Q6P4F2 183 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 CITED4Q96RK1 184 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 RNF208Q9H0X6 261 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 NPHS2Q9NP85 383 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 RAXQ9Y2V3 346 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1W2PP55 124 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 SOWAHDA6NJG2 315 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 GPR182O15218 404 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 BRD1O95696 1058 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 FSTP19883 344 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 A0A096LPE4 126 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 A0A1W2PPZ6 126 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 GSTM4Q03013 218 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 ANKRD34AQ69YU3 496 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 ARMC10Q8N2F6 343 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 NIF3L1Q9GZT8 377 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 EHD4Q9H223 541 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP7.68□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 GAS2O43903 313 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 SLC51AQ86UW1 340 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 CCNJLQ8IV13 435 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 DMRTB1Q96MA1 342 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 STOML1Q9UBI4 398 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 GRIA4P48058 902 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 PCDH1Q08174 1060 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 MYRFLQ96LU7 910 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 FMNL2Q96PY5 1086 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 TCF12Q99081 682 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 RBCK1Q9BYM8 510 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 IFT140Q96RY7 1462 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 GSC2O15499 205 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 SSTR4P31391 388 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 PREPP48147 710 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 SPRED3Q2MJR0 410 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 KIAA0319Q5VV43 1072 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 NUTM2GQ5VZR2 741 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 DNAJC25Q9H1X3 360 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 KCNF1Q9H3M0 494 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 DCTN4Q9UJW0 460 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
PTPRC-211ENST00000484135 KIF27Q86VH2 1401 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 MAPK1P28482 360 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC74AQ96AQ1 378 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 CYP4F12Q9HCS2 524 aa7.64□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 WDR97A6NE52 1622 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 GAPVD1Q14C86 1478 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 IGLV1-40P01703 118 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 BMP3P12645 472 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 CSRNP1Q96S65 589 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 C7orf69Q9H7B7 122 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 MEGF11A6BM72 1044 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 IGHA2P01877 340 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 TMC7Q7Z402 723 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 TRIM42Q8IWZ5 723 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 HOMEZQ8IX15 550 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 FAM20CQ8IXL6 584 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF576Q9H609 170 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 HIF3AQ9Y2N7 669 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 RNF114Q9Y508 228 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 HMX2A2RU54 273 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 RXRBP28702 533 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 NFIAQ12857 509 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF423Q2M1K9 1284 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 BEND4Q6ZU67 534 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 TRAK1Q9UPV9 953 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 DLGAP3O95886 979 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 CYP11A1P05108 521 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 ITPKAP23677 461 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 POU4F3Q15319 338 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 CLEC10AQ8IUN9 316 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRC-211ENST00000484135 CORO1BQ9BR76 489 aa7.6□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms