RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366973.8

TATDN3-201, Transcript of TatD DNase domain containing 3, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TATDN3, Length 2,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TATDN3-201ENST00000366973 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.32
TATDN3-201ENST00000366973 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa17.02■□□□□ 0.32
TATDN3-201ENST00000366973 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 GOLGA8BA8MQT2 603 aa17.02■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 RPS6KA4O75676 772 aa17.02■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 ARMT1Q9H993 441 aa17.02■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 NARFQ9UHQ1 456 aa17.02■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP17.02■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 NKX2-3Q8TAU0 364 aa17.01■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa17.01■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 GYG1P46976 350 aa17.01■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 CHMP4CQ96CF2 233 aa17.01■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 LRP2BPQ9P2M1 347 aa17.01■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 CARMIL3Q8ND23 1372 aa17■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 NHSQ6T4R5 1651 aa17■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa17■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 ZPR1O75312 459 aa17■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 GUCY1B3Q02153 619 aa17■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 GIMAP6Q6P9H5 292 aa17■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 SETDB2Q96T68 719 aa17■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 NAPBQ9H115 298 aa17■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP17■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 HPS5Q9UPZ3 1129 aa17■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 A0A1B0GUL6 1792 aa17■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 WDR19Q8NEZ3 1342 aa17■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 B4E1Z4 1266 aa16.99■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 CYB5R4Q7L1T6 521 aa16.99■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 IFNL3Q8IZI9 196 aa16.99■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 CCDC24Q8N4L8 307 aa16.99■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 FDPSP14324 419 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 LIG1P18858 919 aa16.99■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 AMIGO3Q86WK7 504 aa16.99■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 LCORLQ8N3X6 602 aa16.99■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 MINPP1Q9UNW1 487 aa16.99■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 NEDD4P46934 1319 aa16.99■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 ALX1Q15699 326 aa16.98■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 MIGA1Q8NAN2 632 aa16.98■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 NYXQ9GZU5 481 aa16.98■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 INCENPQ9NQS7 918 aa16.98■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 ABCF2Q9UG63 623 aa16.98■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 MYH15Q9Y2K3 1946 aa16.98■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 ESPNB1AK53 854 aa16.98■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 RGL2O15211 777 aa16.98■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 PRKAB2O43741 272 aa16.98■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 SLC10A5Q5PT55 438 aa16.98■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 ZNF804BA4D1E1 1349 aa16.98■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 CHD4Q14839 1912 aa16.97■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 GSG1L2A8MUP6 293 aa16.97■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 CPLX1O14810 134 aa16.97■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 CTDSPL2Q05D32 466 aa16.97■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 UBE4AQ14139 1066 aa16.97■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 PDLIM2Q96JY6 352 aa16.97■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 CFAP45Q9UL16 551 aa16.97■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 ZMYM6O95789 1325 aa16.97■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 VPS37DQ86XT2 251 aa16.97■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 NLRP3Q96P20 1036 aa16.97■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa16.97■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 TDO2P48775 406 aa16.96■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 CAVIN4Q5BKX8 364 aa16.96■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 PGBD1Q96JS3 809 aa16.96■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP16.96■□□□□ 0.31
TATDN3-201ENST00000366973 CYP7A1P22680 504 aa16.96■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 ADD1P35611 737 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 BICD2Q8TD16 824 aa16.96■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 DACT1Q9NYF0 836 aa16.96■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 RAI14Q9P0K7 980 aa16.96■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 COL24A1Q17RW2 1714 aa16.95■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 AFF2P51816 1311 aa16.95■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 RXRAP19793 462 aa16.95■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 CAMK4Q16566 473 aa16.95■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa16.95■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 ADGRA1Q86SQ6 560 aa16.95■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 FUCA2Q9BTY2 467 aa16.95■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 NUP62CLQ9H1M0 184 aa16.95■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 SENP2Q9HC62 589 aa16.95■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa16.95■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 TAF1LQ8IZX4 1826 aa16.95■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 GNAT2P19087 354 aa16.95■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 RPS8P62241 208 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 TPTE2Q6XPS3 522 aa16.95■□□□□ 0.3
TATDN3-201ENST00000366973 NACAP1Q9BZK3 213 aa16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms