RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP25.26■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 FBF1Q8TES7 1133 aa25.26■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 ARMT1Q9H993 441 aa25.26■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 VAMP4O75379 141 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 TAF12Q16514 161 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 KRT83P78385 493 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 ITGA6P23229 1130 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 PODXL2Q9NZ53 605 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 A2MP01023 1474 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 B4E1Z4 1266 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 RLBP1P12271 317 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 KRT5P13647 590 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 CNBD1Q8NA66 436 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF408Q9H9D4 720 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 CTNND2Q9UQB3 1225 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 IFNKQ9P0W0 207 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 DENND2AQ9ULE3 1009 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 NDC80O14777 642 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 FCHSD1Q86WN1 690 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 NPATQ14207 1427 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 ASXL2Q76L83 1435 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 TIMM10P62072 90 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 IFT81Q8WYA0 676 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC114Q96M63 670 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 PPP1R9BQ96SB3 815 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 KRT86O43790 486 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC25Q86WR0 208 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF569Q5MCW4 686 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC77Q9BR77 488 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 CHMLP26374 656 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 DCTPP1Q9H773 170 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 CEP83Q9Y592 693 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC24Q8N4L8 307 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 UIMC1Q96RL1 719 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 TTC6Q86TZ1 520 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 KLHDC4Q8TBB5 520 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 ARFGAP3Q9NP61 516 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1B0GVL5 298 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 ATRIPQ8WXE1 791 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 SV2BQ7L1I2 683 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 G2E3Q7L622 706 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1B0GUL7 405 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 ATP2A1O14983 1001 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 PRIMPOLQ96LW4 560 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.63
PTPRM-201ENST00000332175 PPP1R7Q15435 360 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 BRAPQ7Z569 592 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 HELLSQ9NRZ9 838 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 BIRC3Q13489 604 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 PICK1Q9NRD5 415 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 LMTK3Q96Q04 1460 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC169A6NNP5 214 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 RHOXF2BP0C7M4 288 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 RHOXF2Q9BQY4 288 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 PRKG1Q13976 671 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 C8orf34Q49A92 452 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 IQUBQ8NA54 791 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 GOLGA1Q92805 767 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 TAF5LO75529 589 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 KRT9P35527 623 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 SNX21Q969T3 373 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 MAEAQ7L5Y9 396 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC65Q8IXS2 484 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 MSANTD4Q8NCY6 345 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC6Q16204 474 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 IP6K1Q92551 441 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 TMOD4Q9NZQ9 345 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 RSPH14Q9UHP6 348 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1W2PP64 1363 aa25.18■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 PSMC4P43686 418 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 TRAF5O00463 557 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 DYNC1I1O14576 645 aa25.17■■□□□ 1.62
PTPRM-201ENST00000332175 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.62
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