RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 CPLX1O14810 134 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 ATP2B3Q16720 1220 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 ABCA3Q99758 1704 aa26.22■■□□□ 1.79
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HOXD1-201ENST00000331462 TAF7LQ5H9L4 462 aa26.21■■□□□ 1.79
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HOXD1-201ENST00000331462 ANO1Q5XXA6 986 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 KIF6Q6ZMV9 814 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC112Q8NEF3 446 aa26.21■■□□□ 1.79
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HOXD1-201ENST00000331462 ADD2P35612 726 aa26.2■■□□□ 1.79
HOXD1-201ENST00000331462 CEP135Q66GS9 1140 aa26.2■■□□□ 1.79
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HOXD1-201ENST00000331462 NBPF3Q9H094 633 aa26.2■■□□□ 1.79
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HOXD1-201ENST00000331462 KIF28PB7ZC32 967 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXD1-201ENST00000331462 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
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HOXD1-201ENST00000331462 TIGD1Q96MW7 591 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXD1-201ENST00000331462 NLRP12P59046 1061 aa26.18■■□□□ 1.78
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HOXD1-201ENST00000331462 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa26.18■■□□□ 1.78
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HOXD1-201ENST00000331462 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF202O95125 648 aa26.17■■□□□ 1.78
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HOXD1-201ENST00000331462 SLC39A14Q15043 492 aa26.17■■□□□ 1.78
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HOXD1-201ENST00000331462 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
HOXD1-201ENST00000331462 TMOD3Q9NYL9 352 aa26.17■■□□□ 1.78
HOXD1-201ENST00000331462 USP27XA6NNY8 438 aa26.16■■□□□ 1.78
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HOXD1-201ENST00000331462 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa26.15■■□□□ 1.78
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HOXD1-201ENST00000331462 PPP6R2O75170 966 aa26.15■■□□□ 1.78
HOXD1-201ENST00000331462 TBC1D10CQ8IV04 446 aa26.15■■□□□ 1.78
HOXD1-201ENST00000331462 TTLL11Q8NHH1 800 aa26.15■■□□□ 1.78
HOXD1-201ENST00000331462 MYH3P11055 1940 aa26.14■■□□□ 1.78
HOXD1-201ENST00000331462 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.77
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HOXD1-201ENST00000331462 NCAPHQ15003 741 aa26.14■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 DNAJC10Q8IXB1 793 aa26.14■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 GJB4Q9NTQ9 266 aa26.14■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 HPSEQ9Y251 543 aa26.14■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 LRP6O75581 1613 aa26.14■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 ARAP2Q8WZ64 1704 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 ITGA6P23229 1130 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 CTSWP56202 376 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 NLRP10Q86W26 655 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM87BQ96K49 555 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 TUBE1Q9UJT0 475 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 ECM29Q5VYK3 1845 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 STARD3NLO95772 234 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP26.13■■□□□ 1.77
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HOXD1-201ENST00000331462 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 PRDM4Q9UKN5 801 aa26.13■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 ALX1Q15699 326 aa26.12■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa26.12■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 APOA5Q6Q788 366 aa26.12■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 CYB5R4Q7L1T6 521 aa26.12■■□□□ 1.77
HOXD1-201ENST00000331462 JMYQ8N9B5 988 aa26.12■■□□□ 1.77
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