RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326277.5

SNX18-201, Transcript of sorting nexin 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX18, Length 2,063 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18-201ENST00000326277 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa26.89■■□□□ 1.89
SNX18-201ENST00000326277 FOSBP53539 338 aa26.89■■□□□ 1.89
SNX18-201ENST00000326277 TRDNQ13061 729 aa26.89■■□□□ 1.89
SNX18-201ENST00000326277 ALX1Q15699 326 aa26.88■■□□□ 1.89
SNX18-201ENST00000326277 NKX2-3Q8TAU0 364 aa26.88■■□□□ 1.89
SNX18-201ENST00000326277 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
SNX18-201ENST00000326277 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
SNX18-201ENST00000326277 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
SNX18-201ENST00000326277 ARMT1Q9H993 441 aa26.88■■□□□ 1.89
SNX18-201ENST00000326277 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
SNX18-201ENST00000326277 HPS5Q9UPZ3 1129 aa26.88■■□□□ 1.89
SNX18-201ENST00000326277 A0A1B0GUL6 1792 aa26.87■■□□□ 1.89
SNX18-201ENST00000326277 SETDB2Q96T68 719 aa26.87■■□□□ 1.89
SNX18-201ENST00000326277 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
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SNX18-201ENST00000326277 ZPR1O75312 459 aa26.86■■□□□ 1.89
SNX18-201ENST00000326277 IFNL3Q8IZI9 196 aa26.86■■□□□ 1.89
SNX18-201ENST00000326277 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
SNX18-201ENST00000326277 ZNF804BA4D1E1 1349 aa26.86■■□□□ 1.89
SNX18-201ENST00000326277 ZMYM6O95789 1325 aa26.86■■□□□ 1.89
SNX18-201ENST00000326277 CARMIL3Q8ND23 1372 aa26.86■■□□□ 1.89
SNX18-201ENST00000326277 FDPSP14324 419 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
SNX18-201ENST00000326277 CYB5R4Q7L1T6 521 aa26.86■■□□□ 1.89
SNX18-201ENST00000326277 AMIGO3Q86WK7 504 aa26.86■■□□□ 1.89
SNX18-201ENST00000326277 NYXQ9GZU5 481 aa26.86■■□□□ 1.89
SNX18-201ENST00000326277 MINPP1Q9UNW1 487 aa26.86■■□□□ 1.89
SNX18-201ENST00000326277 GYG1P46976 350 aa26.85■■□□□ 1.89
SNX18-201ENST00000326277 UBE4AQ14139 1066 aa26.85■■□□□ 1.89
SNX18-201ENST00000326277 LRP2BPQ9P2M1 347 aa26.85■■□□□ 1.89
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SNX18-201ENST00000326277 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
SNX18-201ENST00000326277 NAPBQ9H115 298 aa26.84■■□□□ 1.89
SNX18-201ENST00000326277 GSG1L2A8MUP6 293 aa26.83■■□□□ 1.89
SNX18-201ENST00000326277 B4E1Z4 1266 aa26.83■■□□□ 1.89
SNX18-201ENST00000326277 LCORLQ8N3X6 602 aa26.83■■□□□ 1.89
SNX18-201ENST00000326277 PDLIM2Q96JY6 352 aa26.83■■□□□ 1.89
SNX18-201ENST00000326277 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
SNX18-201ENST00000326277 COL24A1Q17RW2 1714 aa26.83■■□□□ 1.89
SNX18-201ENST00000326277 NEDD4P46934 1319 aa26.83■■□□□ 1.89
SNX18-201ENST00000326277 PRKAB2O43741 272 aa26.83■■□□□ 1.89
SNX18-201ENST00000326277 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
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SNX18-201ENST00000326277 GIMAP6Q6P9H5 292 aa26.83■■□□□ 1.89
SNX18-201ENST00000326277 ADD1P35611 737 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 NLRP3Q96P20 1036 aa26.82■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa26.82■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa26.81■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 GUCY1B3Q02153 619 aa26.81■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
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SNX18-201ENST00000326277 CFAP45Q9UL16 551 aa26.81■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
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SNX18-201ENST00000326277 MIGA1Q8NAN2 632 aa26.81■■□□□ 1.88
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SNX18-201ENST00000326277 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 GNAT2P19087 354 aa26.8■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 CTDSPL2Q05D32 466 aa26.8■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 FUCA2Q9BTY2 467 aa26.8■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa26.8■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 RPS8P62241 208 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 CAVIN4Q5BKX8 364 aa26.8■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 TPTE2Q6XPS3 522 aa26.8■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 KLHL34Q8N239 644 aa26.8■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 ABCF2Q9UG63 623 aa26.8■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 LY75O60449 1722 aa26.8■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 MYH15Q9Y2K3 1946 aa26.79■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 TAF1LQ8IZX4 1826 aa26.79■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 ESPNB1AK53 854 aa26.79■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 CPLX1O14810 134 aa26.79■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 ADGRA1Q86SQ6 560 aa26.79■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 CYP7A1P22680 504 aa26.78■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 TMEM87BQ96K49 555 aa26.78■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 NACAP1Q9BZK3 213 aa26.78■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 TACC3Q9Y6A5 838 aa26.78■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 VPS37DQ86XT2 251 aa26.78■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa26.78■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 SENP2Q9HC62 589 aa26.78■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 TDO2P48775 406 aa26.77■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 RAI14Q9P0K7 980 aa26.77■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 C4AP0C0L4 1744 aa26.77■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 C4BP0C0L5 1744 aa26.77■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 AFF2P51816 1311 aa26.77■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 AKNAD1Q5T1N1 836 aa26.77■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP26.77■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 DACT1Q9NYF0 836 aa26.77■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 SBF2Q86WG5 1849 aa26.77■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 TIAM2Q8IVF5 1701 aa26.76■■□□□ 1.88
SNX18-201ENST00000326277 NUP62CLQ9H1M0 184 aa26.76■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 CHD4Q14839 1912 aa26.75■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 KLRK1P26718 216 aa26.75■■□□□ 1.87
SNX18-201ENST00000326277 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa26.75■■□□□ 1.87
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