RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000303004.4

CEBPB-201, Transcript of CCAAT enhancer binding protein beta, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CEBPB, Length 1,956 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEBPB-201ENST00000303004 ANO1Q5XXA6 986 aa27.65■■■□□ 2.02
CEBPB-201ENST00000303004 NYAP1Q6ZVC0 841 aa27.65■■■□□ 2.02
CEBPB-201ENST00000303004 TIGD1Q96MW7 591 aa27.65■■■□□ 2.02
CEBPB-201ENST00000303004 TMOD3Q9NYL9 352 aa27.65■■■□□ 2.02
CEBPB-201ENST00000303004 C4AP0C0L4 1744 aa27.65■■■□□ 2.02
CEBPB-201ENST00000303004 C4BP0C0L5 1744 aa27.65■■■□□ 2.02
CEBPB-201ENST00000303004 CDKL5O76039 1030 aa27.64■■■□□ 2.02
CEBPB-201ENST00000303004 SKILP12757 684 aa27.64■■■□□ 2.02
CEBPB-201ENST00000303004 CCZ1BP86790 482 aa27.64■■■□□ 2.02
CEBPB-201ENST00000303004 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
CEBPB-201ENST00000303004 UBE3CQ15386 1083 aa27.64■■■□□ 2.02
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CEBPB-201ENST00000303004 CCDC112Q8NEF3 446 aa27.64■■■□□ 2.02
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CEBPB-201ENST00000303004 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa27.64■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa27.64■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 CCDC69A6NI79 296 aa27.64■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 TRDNQ13061 729 aa27.64■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 CEP135Q66GS9 1140 aa27.64■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 FAM89AQ96GI7 184 aa27.64■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa27.63■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa27.63■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa27.63■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 MCAMP43121 646 aa27.62■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 METTL24Q5JXM2 366 aa27.62■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 FAM177BA6PVY3 158 aa27.62■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 PPFIA3O75145 1194 aa27.62■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 NLRP12P59046 1061 aa27.62■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 SLC39A14Q15043 492 aa27.62■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 ZNF202O95125 648 aa27.61■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 STARD3NLO95772 234 aa27.61■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 KCNJ6P48051 423 aa27.61■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 TPM4P67936 248 aa27.61■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
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CEBPB-201ENST00000303004 VGLL2Q8N8G2 317 aa27.6■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 TTLL11Q8NHH1 800 aa27.6■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 NBPF3Q9H094 633 aa27.6■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 KIF28PB7ZC32 967 aa27.6■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 PPP6R2O75170 966 aa27.6■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 NBPF11Q86T75 865 aa27.6■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 TMEM87BQ96K49 555 aa27.6■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa27.59■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 PTPN14Q15678 1187 aa27.59■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 DPCR1Q3MIW9 517 aa27.59■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa27.59■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 CCDC150Q8NCX0 1101 aa27.59■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 FEZ1Q99689 392 aa27.59■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa27.59■■■□□ 2.01
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CEBPB-201ENST00000303004 ITGA6P23229 1130 aa27.59■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 ARID5BQ14865 1188 aa27.59■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 ALX1Q15699 326 aa27.59■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 NLRP10Q86W26 655 aa27.59■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 JMYQ8N9B5 988 aa27.59■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 PFKFB1P16118 471 aa27.58■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 CTSWP56202 376 aa27.58■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 PI16Q6UXB8 463 aa27.58■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa27.58■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 DNAJC10Q8IXB1 793 aa27.58■■■□□ 2.01
CEBPB-201ENST00000303004 ABCA3Q99758 1704 aa27.58■■■□□ 2
CEBPB-201ENST00000303004 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP27.57■■■□□ 2
CEBPB-201ENST00000303004 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa27.57■■■□□ 2
CEBPB-201ENST00000303004 A0A087WWV3 80 aa27.57■■■□□ 2
CEBPB-201ENST00000303004 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa27.57■■■□□ 2
CEBPB-201ENST00000303004 HPSEQ9Y251 543 aa27.57■■■□□ 2
CEBPB-201ENST00000303004 TBC1D10CQ8IV04 446 aa27.56■■■□□ 2
CEBPB-201ENST00000303004 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
CEBPB-201ENST00000303004 ALG1Q9BT22 464 aa27.56■■■□□ 2
CEBPB-201ENST00000303004 TUBE1Q9UJT0 475 aa27.56■■■□□ 2
CEBPB-201ENST00000303004 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
CEBPB-201ENST00000303004 TUBB4AP04350 444 aa27.55■■■□□ 2
CEBPB-201ENST00000303004 SGMS1Q86VZ5 419 aa27.55■■■□□ 2
CEBPB-201ENST00000303004 GREM2Q9H772 168 aa27.55■■■□□ 2
CEBPB-201ENST00000303004 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
CEBPB-201ENST00000303004 PDE8BO95263 885 aa27.55■■■□□ 2
CEBPB-201ENST00000303004 NCAPHQ15003 741 aa27.55■■■□□ 2
CEBPB-201ENST00000303004 APOA5Q6Q788 366 aa27.55■■■□□ 2
CEBPB-201ENST00000303004 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa27.55■■■□□ 2
CEBPB-201ENST00000303004 MYO1BO43795 1136 aa27.54■■■□□ 2
CEBPB-201ENST00000303004 CYB5R4Q7L1T6 521 aa27.54■■■□□ 2
CEBPB-201ENST00000303004 PIGBQ92521 554 aa27.54■■■□□ 2
CEBPB-201ENST00000303004 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
CEBPB-201ENST00000303004 ARID3AQ99856 593 aa27.54■■■□□ 2
CEBPB-201ENST00000303004 CNNM1Q9NRU3 951 aa27.54■■■□□ 2
CEBPB-201ENST00000303004 STK36Q9NRP7 1315 aa27.54■■■□□ 2
CEBPB-201ENST00000303004 LRP5O75197 1615 aa27.53■■■□□ 2
CEBPB-201ENST00000303004 USP27XA6NNY8 438 aa27.53■■■□□ 2
CEBPB-201ENST00000303004 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP27.53■■■□□ 2
CEBPB-201ENST00000303004 VPS37DQ86XT2 251 aa27.53■■■□□ 2
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