RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300057.4

MESP1-201, Transcript of mesoderm posterior bHLH transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MESP1, Length 2,369 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1-201ENST00000300057 ZPR1O75312 459 aa25.23■■□□□ 1.63
MESP1-201ENST00000300057 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
MESP1-201ENST00000300057 UBE2HP62256 183 aa25.23■■□□□ 1.63
MESP1-201ENST00000300057 MAP3K12Q12852 859 aa25.23■■□□□ 1.63
MESP1-201ENST00000300057 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
MESP1-201ENST00000300057 FAM184AQ8NB25 1140 aa25.23■■□□□ 1.63
MESP1-201ENST00000300057 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
MESP1-201ENST00000300057 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
MESP1-201ENST00000300057 PRC1O43663 620 aa25.22■■□□□ 1.63
MESP1-201ENST00000300057 KIAA2012Q0VF49 1180 aa25.22■■□□□ 1.63
MESP1-201ENST00000300057 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.22■■□□□ 1.63
MESP1-201ENST00000300057 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
MESP1-201ENST00000300057 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
MESP1-201ENST00000300057 NCOA7Q8NI08 942 aa25.22■■□□□ 1.63
MESP1-201ENST00000300057 DOCK2Q92608 1830 aa25.21■■□□□ 1.63
MESP1-201ENST00000300057 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
MESP1-201ENST00000300057 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa25.21■■□□□ 1.63
MESP1-201ENST00000300057 SETDB2Q96T68 719 aa25.21■■□□□ 1.63
MESP1-201ENST00000300057 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
MESP1-201ENST00000300057 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
MESP1-201ENST00000300057 PPFIA3O75145 1194 aa25.2■■□□□ 1.63
MESP1-201ENST00000300057 CTDNEP1O95476 244 aa25.2■■□□□ 1.63
MESP1-201ENST00000300057 CCDC24Q8N4L8 307 aa25.2■■□□□ 1.63
MESP1-201ENST00000300057 PRIMPOLQ96LW4 560 aa25.2■■□□□ 1.63
MESP1-201ENST00000300057 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
MESP1-201ENST00000300057 NBPF3Q9H094 633 aa25.2■■□□□ 1.63
MESP1-201ENST00000300057 AFF2P51816 1311 aa25.2■■□□□ 1.63
MESP1-201ENST00000300057 PTPDC1A2A3K4 754 aa25.2■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 H3BQV1 296 aa25.2■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 FOSBP53539 338 aa25.2■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 KRT85P78386 507 aa25.2■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 IFFO2Q5TF58 517 aa25.2■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 MBD4O95243 580 aa25.19■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 GYG1P46976 350 aa25.18■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 ANTXR2P58335 489 aa25.18■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 TBC1D10CQ8IV04 446 aa25.18■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 NYXQ9GZU5 481 aa25.18■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 DENND2AQ9ULE3 1009 aa25.18■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 RGL2O15211 777 aa25.18■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 ARMT1Q9H993 441 aa25.18■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 A0A1B0GUL6 1792 aa25.18■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 PHF14O94880 888 aa25.17■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 HSPA1LP34931 641 aa25.17■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 SLC10A5Q5PT55 438 aa25.17■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 FBXL16Q8N461 479 aa25.17■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 LRP2BPQ9P2M1 347 aa25.17■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 MINPP1Q9UNW1 487 aa25.17■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 PTMAP06454 111 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 TRDNQ13061 729 aa25.16■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 TTC6Q86TZ1 520 aa25.16■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 KIF20AO95235 890 aa25.16■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.15■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.15■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa25.15■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 CCDC183Q5T5S1 534 aa25.15■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa25.15■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 NLRP3Q96P20 1036 aa25.15■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 LY75O60449 1722 aa25.15■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP25.15■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 SBF2Q86WG5 1849 aa25.14■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 GOLGA8BA8MQT2 603 aa25.14■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 EVCP57679 992 aa25.14■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 RESTQ13127 1097 aa25.14■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 SEPT12Q8IYM1 358 aa25.14■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 NKX2-3Q8TAU0 364 aa25.14■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 CERKQ8TCT0 537 aa25.14■■□□□ 1.62
MESP1-201ENST00000300057 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
MESP1-201ENST00000300057 UBE4AQ14139 1066 aa25.13■■□□□ 1.61
MESP1-201ENST00000300057 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
MESP1-201ENST00000300057 NAPBQ9H115 298 aa25.13■■□□□ 1.61
MESP1-201ENST00000300057 ABCF2Q9UG63 623 aa25.13■■□□□ 1.61
MESP1-201ENST00000300057 ZNF804BA4D1E1 1349 aa25.13■■□□□ 1.61
MESP1-201ENST00000300057 SALL1Q9NSC2 1324 aa25.13■■□□□ 1.61
MESP1-201ENST00000300057 TPTE2Q6XPS3 522 aa25.13■■□□□ 1.61
MESP1-201ENST00000300057 IFNL3Q8IZI9 196 aa25.13■■□□□ 1.61
MESP1-201ENST00000300057 LCORLQ8N3X6 602 aa25.13■■□□□ 1.61
MESP1-201ENST00000300057 MIGA1Q8NAN2 632 aa25.13■■□□□ 1.61
MESP1-201ENST00000300057 TSPY26PQ9H489 355 aa25.13■■□□□ 1.61
MESP1-201ENST00000300057 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
MESP1-201ENST00000300057 KIF3AQ9Y496 699 aa25.13■■□□□ 1.61
MESP1-201ENST00000300057 NPHP1O15259 732 aa25.12■■□□□ 1.61
MESP1-201ENST00000300057 CYB5R4Q7L1T6 521 aa25.12■■□□□ 1.61
MESP1-201ENST00000300057 VPS37DQ86XT2 251 aa25.12■■□□□ 1.61
MESP1-201ENST00000300057 C4BP0C0L5 1744 aa25.12■■□□□ 1.61
MESP1-201ENST00000300057 PRKAB2O43741 272 aa25.12■■□□□ 1.61
MESP1-201ENST00000300057 NEDD4P46934 1319 aa25.12■■□□□ 1.61
MESP1-201ENST00000300057 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
MESP1-201ENST00000300057 B4E1Z4 1266 aa25.11■■□□□ 1.61
MESP1-201ENST00000300057 RFC4P35249 363 aa25.11■■□□□ 1.61
MESP1-201ENST00000300057 CAVIN4Q5BKX8 364 aa25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.8 ms